Karang keras yang paling banyak ditemukan berasal dari Acropora dan Porites. Total jumlah genera yang ditemukan sebanyak 59 genera. Dengan kondisi Nilai rata-rata tutupan karang keras sebesar 60%

 
Keragaman jenis ikan karang ditemukan sebanyak 485 spesies, dengan jenis famili paling banyak ditemui yaitu famili Pomacentridae dari jenis Pomacentrus alexanderae, Amblyglyphidodon curacao, P. moluccensis dan Chromis viridis, sebagaimana famili tersebut merupakan kelompok ikan mayor, atau penguhi utama pada ekosistem terumbu karang, dengan kondisi kelimpahan ikan karang 16.045,16 no.ha-1 , serta nilai biomass ikan karang sebesar sebesar 176,475 kg.ha-1

Padang lamun di TWP Pulau Liang dan Pulau Ngali mencapai 1132,15 Ha

Mangrove di TWP Pulau Liang dan Pulau Ngali mencapai 574,71 Ha