Recent publications
Find out most recent adverts on our
Twitter
2024
Strzałka A, Mikołajczyck J., Kowalska K, Skurczyński M, Holmes NA, Jakimowicz D.
doi: 10.1186/s12934-024-02549-0, Microb. Cell Fact., 2024
Duława-Kobeluszczyk J, Strzałka A, Tracz M, Bartyńska M, Pawlikiewicz K, Łebkowski T, Wróbel S, Szymczak J, Zarek A, Jakimowicz D, Szafran MJ.
doi: 10.1093/nar/gkae418, Nucleic Acids Res., 2024
Bułacz H, Hołowka J, Wójcik W, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.1038/s41598-024-70054-w, Sci. Rep., 2024
2023
Matusiak I, Strzałka A, Wadach P, Gongerowska-Jac M, Szwajczak E, Szydłowska-Helbrych A, Kepplinger B, Pióro M, Jakimowicz D
doi: 10.1128/spectrum.01752-23 , Microbiol. Spectr, 2023
Noszka M, Strzałka A, Muraszko J, Kolenda R, Meng C, Ludwig C, Stingl K, Zawilak-Pawlik A.
doi: 10.1038/s41467-023-42364-6, Nat Commun, 2023
Pląskowska K, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.1093/femsre/fuad057, FEMS Microbiol Rev, 2023
Pląskowska K, Makowski Ł, Strzałka A, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.1128/mbio.00772-23, mBio, 2023
Hołówka J, Łebkowski T, Feddersen H, Giacomelli G, Drużka K, Makowski Ł, Trojanowski D, Broda N, Bramkamp M, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.3389/fmicb.2023.1146406, Front Microbiol, 2023
Kawai Y, Kawai M, Mackenzie ES, Dashti Y, Kepplinger B, Waldron KJ, Errington J.
doi: 10.1038/s41467-023-39723-8, Nat Commun, 2023
2022
Strzałka A, Kois-Ostrowska A, Kędra M, Łebkowski T, Bieniarz G, Szafran MJ, Jakimowicz D.
doi: 10.1093/nar/gkac1093, Nucleic Acids Res, 2022
Pióro M, Matusiak I, Gawek A, Łebkowski T, Jaroszek P, Bergé M, Böhm K, Armitage J, Viollier PH, Bramkamp M, Jakimowicz D.
doi: 10.3389/fmicb.2022.928139, Front Microbiol, 2022
Kepplinger B, Wen X, Tyler AR, Kim BY, Brown J, Banks P, Dashti Y, Mackenzie ES, Wills C, Kawai Y, Waldron KJ, Allenby NEE, Wu LJ, Hall MJ, Errington J.
doi: 10.3389/fmicb.2022.1004737, Front Microbiol, 2022
Kepplinger B, Mardiana L, Cowell J, Morton-Laing S, Dashti Y, Wills C, Marrs ECL, Perry JD, Gray J, Goodfellow M, Errington J, Probert MR, Clegg W, Bogaerts J, Herrebout W, Allenby NEE, Hall MJ.
doi: 10.1038/s41598-022-18726-3, Sci Rep, 2022
Watson AK, Kepplinger B, Bakhiet SM, Mhmoud NA, Chapman J, Allenby NE, Mickiewicz K, Goodfellow M, Fahal AH, Errington J.
doi: 10.1371/journal.pntd.0010128, PLoS Negl Trop Dis, 2022
2021
Płachetka M, Krawiec M, Zakrzewska-Czerwińska J, Wolański M.
doi: 10.1128/Spectrum.01981-21, Microbiol Spectr, 2021
Gongerowska-Jac M, Szafran MJ, Mikołajczyk J, Szymczak J, Bartyńska M, Gierlikowska A, Biały S, Elliot MA, Jakimowicz D.
doi: 10.1128/mSystems.01142-21, mSystems, 2021
Spatial rearrangement of the Streptomyces venezuelae linear chromosome during sporogenic development
Szafran MJ, Małecki T, Strzałka A, Pawlikiewicz K, Duława J, Zarek A, Kois-Ostrowska A, Findlay KC, Le TBK, Jakimowicz D
doi: 10.1038/s41467-021-25461-2, Nat Commun, 2021
Pawełczyk J, Brzostek A, Minias A, Płociński P, Rumijowska-Galewicz A, Strapagiel D, Zakrzewska-Czerwińska J, Dziadek J.
doi: 10.1038/s41598-021-91812-0, Sci Rep, 2021
Gongerowska-Jac M, Szafran MJ, Jakimowicz D.
doi: 10.1186/s12934-021-01590-7, Microb Cell Fact, 2021
Kołodziej M, Łebkowski T, Płociński P, Hołówka J, Paściak M, Wojtaś B, Bury K, Konieczny I, Dziadek J, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.1128/mSphere.00290-21, mSphere, 2021
Kowalczyk A, Paneth A, Trojanowski D, Paneth P, Zakrzewska-Czerwińska J, Stączek P.
doi: 10.3390/ijms22083881, Int J Mol Sci, 2021
Botas A, Eitel M, Schwarz PN, Buchmann A, Costales P, Núñez LE, Cortés J, Morís F, Krawiec M, Wolański M, Gust B, Rodriguez M, Fischer WN, Jandeleit B, Zakrzewska- Czerwińska J, Wohlleben W, Stegmann E, Koch P, Méndez C, Gross H.
doi: 10.1002/anie.202015852, Angew Chem Int Ed Engl, 2021
Kołodziej M, Trojanowski D, Bury K, Hołówka J, Matysik W, Kąkolewska H, Feddersen H, Giacomelli G, Konieczny I, Bramkamp M, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.1038/s41598-021-82295-0, Sci Rep, 2021
2020
Wolański M, Krawiec M, Schwarz PN, Stegmann E, Wohlleben W, Buchmann A, Gross H, Eitel M, Koch P, Botas A, Méndez C, Núñez LE, Morís F, Cortés J, Zakrzewska- Czerwińska J.
doi: 10.1002/elsc.202000038, Eng Life Sci, 2020
Czubat B, Minias A, Brzostek A, Żaczek A, Struś K, Zakrzewska-Czerwińska J, Dziadek J.
doi: 10.3389/fmicb.2020.0200, Front Microbiol, 2020
Szafran MJ, Jakimowicz D, Elliot MA.
doi: 10.1093/femsre/fuaa028, FEMS Microbiol Rev, 2020
Makowski Ł, Trojanowski D, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.3791/61105, J Vis Exp, 2020
Hołówka J, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.3389/fmicb.2020.00590, Front Microbiol, 2020
Pióro M, Jakimowicz D.
doi: 10.3389/fmicb.2020.00588, Front Microbiol, 2020
Łebkowski T, Wolański M, Ołdziej S, Flärdh K, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.1128/JB.00597-19, J Bacteriol, 2020
2019
Molekularne podstawy organizacji chromatyny bakteryjnej [Molecular mechanisms involved in bacterial chromatin organization].
Kołodziej M, Zakrzewska-Czerwińska J, Hołówka J.
doi: 10.18388/pb.2019_270, Postepy Biochem, 2019
Streptomycete origin of chromosomal replication with two putative unwinding elements
Płachetka M, Żyła-Uklejewicz D, Weigel C, Donczew R, Donczew M, Jakimowicz D, Zawilak-Pawlik A, Zakrzewska-Czerwinska J.
doi: 10.1099/mic.0.000859, Microbiology (Reading), 2019
A highly processive actinobacterial topoisomerase I - thoughts on Streptomyces' demand for an enzyme with a unique C-terminal domain
Szafran MJ, Strzałka A, Jakimowicz D.
doi: 10.1099/mic.0.000841, Microbiology (Reading), 2020
Dynamics of Chromosome Replication and Its Relationship to Predatory Attack Lifestyles in Bdellovibrio bacteriovorus
Makowski Ł, Trojanowski D, Till R, Lambert C, Lowry R, Sockett RE, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.1128/AEM.00730-19, Appl Environ Microbiol, 2019
Transcriptional Response of Streptomyces coelicolor to Rapid Chromosome Relaxation or Long-Term Supercoiling Imbalance
Szafran MJ, Gongerowska M, Małecki T, Elliot M, Jakimowicz D.
doi: 10.3389/fmicb.2019.01605, Front Microbiol, 2019
Watching DNA Replication Inhibitors in Action: Exploiting Time-Lapse Microfluidic Microscopy as a Tool for Target-Drug Interaction Studies in Mycobacterium
Trojanowski D, Kołodziej M, Hołówka J, Müller R, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.1128/AAC.00739-19, Antimicrob Agents Chemother, 2019
2018
Where and When Bacterial Chromosome Replication Starts: A Single Cell Perspective
Trojanowski D, Hołówka J, Zakrzewska-Czerwińska J.
doi: 10.3389/fmicb.2018.02819, Front Microbiol, 2018
Competition between DivIVA and the nucleoid for ParA binding promotes segrosome separation and modulates mycobacterial cell elongation
Pióro M, Małecki T, Portas M, Magierowska I, Trojanowski D, Sherratt D, Zakrzewska-Czerwińska J, Ginda K, Jakimowicz D.
doi: 10.1111/mmi.14149, Mol Microbiol, 2018
Amsacrine Derivatives Selectively Inhibit Mycobacterial Topoisomerase I (TopA), Impair M. smegmatis Growth and Disturb Chromosome Replication
Szafran MJ, Kołodziej M, Skut P, Medapi B, Domagała A, Trojanowski D, Zakrzewska-Czerwińska J, Sriram D, Jakimowicz D.
doi: 10.3389/fmicb.2018.01592, Front Microbiol, 2018
2017
Hołówka J, Trojanowski D, Janczak M, Jakimowicz D, Zakrzewska-Czerwińska J The Origin of Chromosomal Replication Is Asymmetrically Positioned on the Mycobacterial Nucleoid, and the Timing of Its Firing Depends on HupB.J Bacteriol. 2018 Apr 24;200(10). pii: e00044-18. doi: 10.1128/JB.00044-18.
Hołówka J, Trojanowski D, Ginda K, Wojtaś B, Gielniewski B, Jakimowicz D, Zakrzewska-Czerwińska J HupB Is a Bacterial Nucleoid-Associated Protein with an Indispensable Eukaryotic-Like TailMBio. 2017 Nov 7;8(6). pii: e01272-17. doi: 10.1128/mBio.01272-17.
Strzalka A, Szafran MJ, Strick T, Jakimowicz D C-terminal lysine repeats in Streptomyces topoisomerase I stabilize the enzyme-DNA complex and confer high enzyme processivity. Nucleic Acids Res. 2017 Nov 16;45(20):11908-11924.
Ginda K, Santi I, Bousbaine D, Zakrzewska-Czerwińska J, Jakimowicz D, McKinney J. The studies of ParA and ParB dynamics reveal asymmetry of chromosome segregation in Mycobacteria. Mol Microbiol. 2017 May 18. doi: 10.1111/mmi.13712.
Zawilak-Pawlik A, Nowaczyk M, Zakrzewska-Czerwińska J. The Role of the N-Terminal Domains of Bacterial Initiator DnaA in the Assembly and Regulation of the Bacterial Replication Initiation Complex. Genes (Basel). 2017 May 10;8(5). pii: E136. doi: 10.3390/genes8050136. Review. PubMed PMID: 28489024; PubMed Central PMCID: PMC5448010.
Trojanowski D, Hołówka J, Ginda K, Jakimowicz D, Zakrzewska-Czerwińska J. Multifork chromosome replication in slow-growing bacteria. Scientific Reports. 2017 Mar 6. doi:10.1038/srep43836
Zawilak-Pawlik A, Zakrzewska-Czerwińska J. Recent Advances in Helicobacter pylori Replication: Possible Implications in Adaptation to a Pathogenic Lifestyle and Perspectives for Drug Design. Curr Top Microbiol Immunol. 2017;400:73-103. doi: 10.1007/978-3-319-50520-6_4. PMID: 28124150
2016 and before
Buchmann A, Eitel M, Koch P, Schwarz PN, Stegmann E, Wohlleben W, Wolański M, Krawiec M, Zakrzewska-Czerwińska J, Méndez C, Botas A, Núñez LE, Morís F, Cortés J, Gross H. High-Quality Draft Genome Sequence of the Actinobacterium Nocardia terpenica IFM 0406, Producer of the Immunosuppressant Brasilicardins, Using Illumina and PacBio Technologies. Genome Announc. 2016 Dec 15;4(6). pii: e01391-16. doi: 10.1128/genomeA.01391-16. PMID: 27979943
Kois-Ostrowska A, Strzałka A, Lipietta N, Tilley E, Zakrzewska-Czerwińska J, Herron P, Jakimowicz D. Unique Function of the Bacterial Chromosome Segregation Machinery in Apically Growing Streptomyces - Targeting the Chromosome to New Hyphal Tubes and its Anchorage at the Tips. PLoS Genet. 2016 Dec 15;12(12):e1006488. doi: 10.1371/journal.pgen.1006488
Makowski Ł, Donczew R, Weigel C, Zawilak-Pawlik A, Zakrzewska-Czerwińska J. Initiation of Chromosomal Replication in Predatory Bacterium Bdellovibrio bacteriovorus. Front Microbiol. 2016 Nov 28;7:1898. eCollection 2016. PMID: 27965633
Szafran MJ, Gongerowska M, Gutkowski P, Zakrzewska-Czerwińska J, Jakimowicz D. The coordinated positive regulation of topoisomerase genes maintains topological homeostasis in Streptomyces coelicolor. J Bacteriol.2016 Aug 22. pii: JB.00530-16.
Donczew M, Mackiewicz P, Wróbel A, Flärdh K, Zakrzewska-Czerwińska J, Jakimowicz D. ParA and ParB coordinate chromosome segregation with cell elongation and division during Streptomyces sporulation. Open Biol.2016 Apr;6(4):150263. doi: 10.1098/rsob.150263. Epub 2016 Apr 27.
Wolański M, Łebkowski T, Kois-Ostrowska A, Zettler J, Apel AK, Jakimowicz D, Zakrzewska-Czerwińska J. Two transcription factors, CabA and CabR, are independently involved in multilevel regulation of the biosynthetic gene cluster encoding the novel aminocoumarin, cacibiocin. Appl Microbiol Biotechnol. 2016 Apr;100(7):3147-64. doi: 10.1007/s00253-015-7196-7. Epub 2015 Dec 5.
Baronian G, Ginda K, Berry L, Cohen-Gonsaud M, Zakrzewska-Czerwińska J, Jakimowicz D, Molle V. Phosphorylation of Mycobacterium tuberculosis ParB participates in regulating the ParABS chromosome segregation system.PLoS One. 2015 Mar 25;10(3):e0119907. doi: 10.1371/journal.pone.0119907. eCollection 2015.
Trojanowski D, Ginda K, Pióro M, Hołówka J, Skut P, Jakimowicz D, Zakrzewska-Czerwińska J. Choreography of the Mycobacterium replication machinery during the cell cycle.MBio. 2015 Feb 17;6(1):e02125-14. doi: 10.1128/mBio.02125-14.
Wolański M, Donczew R, Zawilak-Pawlik A, Zakrzewska-Czerwińska J. oriC-encoded instructions for the initiation of bacterial chromosome replication.Front Microbiol. 2015 Jan 6;5:735. doi: 10.3389/fmicb.2014.00735. eCollection 2014.
Donczew R, Makowski Ł, Jaworski P, Bezulska M, Nowaczyk M, Zakrzewska-Czerwińska J, Zawilak-Pawlik A. The atypical response regulator HP1021 controls formation of the Helicobacter pylori replication initiation complex.Mol Microbiol. 2015 Jan;95(2):297-312. doi: 10.1111/mmi.12866. Epub 2014 Dec 19.
Wolański M, Jakimowicz D, Zakrzewska-Czerwińska J Fifty years after the replicon hypothesis: cell-specific master regulators as new players in chromosome replication control.J Bacteriol. 2014 Aug 15;196(16):2901-11. doi: 10.1128/JB.01706-14. Epub 2014 Jun 9. Review. PMID: 24914187
Szafran MJ, Strick T, Strzałka A, Zakrzewska-Czerwińska J, Jakimowicz D. A highly processive topoisomerase I: studies at the single-molecule level.Nucleic Acids Res. 2014 Jul;42(12):7935-46. doi: 10.1093/nar/gku494. Epub 2014 May 31.
Donczew R, Mielke T, Jaworski P, Zakrzewska-Czerwińska J, Zawilak-Pawlik A. Assembly of Helicobacter pylori initiation complex is determined by sequence-specific and topology-sensitive DnaA-oriC interactions.J Mol Biol. 2014 Jul 29;426(15):2769-82. doi: 10.1016/j.jmb.2014.05.018. Epub 2014 May 24. PMID: 24862285
Rowinska-Zyrek M, Zakrzewska-Czerwinska J, Zawilak-Pawlik A, Kozlowski H. Ni²⁺ chemistry in pathogens--a possible target for eradication.Dalton Trans. 2014 Jun 28;43(24):8976-89. doi: 10.1039/c4dt00421c. Erratum in: Dalton Trans. 2014 Nov 28;43(44):16943.PMID: 24781528
Donczew R, Zakrzewska-Czerwińska J, Zawilak-Pawlik A. Beyond DnaA: the role of DNA topology and DNA methylation in bacterial replication initiation.J Mol Biol. 2014 Jun 12;426(12):2269-82. doi: 10.1016/j.jmb.2014.04.009. Epub 2014 Apr 18. Review. PMID: 24747048
Masiewicz P, Wolański M, Brzostek A, Dziadek J, Zakrzewska-Czerwińska J. Propionate represses the dnaA gene via the methylcitrate pathway-regulating transcription factor, PrpR, in Mycobacterium tuberculosis.Antonie Van Leeuwenhoek. 2014 May;105(5):951-9. doi: 10.1007/s10482-014-0153-0. Epub 2014 Apr 5.
Szafran M, Skut P, Ditkowski B, Ginda K, Chandra G, Zakrzewska-Czerwińska J, Jakimowicz D. Topoisomerase I (TopA) is recruited to ParB complexes and is required for proper chromosome organization during Streptomyces coelicolor sporulation.J Bacteriol. 2013 Oct;195(19):4445-55. doi: 10.1128/JB.00798-13. Epub 2013 Aug 2.