参考資料ダウンロード
(順次足していきます 準備中)
多変量解析に関する必読文献
- 微生物群集の多変量解析に必要な基礎知識の解説が網羅されています。Alban Ramette (2007) FEMS Microbiol Ecol 62 (2): 142-160
- 生態群集一般に関して、多様性の「違い」を評価する指標は星の数ほどあります。それぞれの指標が、多様性という一種あいまいなもののどの側面に重点をおいて違いを評価するか、これがうまくまとまっている図5が必見です。Marti J. Anderson et al. (2011) Ecology Letters 14: 19–28
微生物群集の生態学に関する必読文献
- エコプレートによる細菌群集の多機能性評価・比較ゲノミクス・微小生態系実験を組み合わせ、種の絶滅による生態系機能の減少予測方法を提唱した画期的(?)論文。T. Miki, T. Yokokawa, K. Matsui* (2014) Proceedings of The Royal Society B vol.281 no.1776 20132498 FREE
多変量解析に関するおすすめ文献
- 微生物生態学全般に関する解析ツールの解説。Pier Luigi Buttigieg Alban Ramette (2014) FEMS Microbiol Ecol 90 (3): 543-550 FREE
微生物群集の生態学に関するおすすめ文献
- 微生物群集がさまざまな増殖速度の個体群の混合体であることを示した総説。David L. Kirchman (2016) Annual Review of Marine Science Vol. 8:285-309
Rスクリプト(講習会で使います)
Rスクリプト(講習会で使います)
[1] 9:00-10:00 (プレ講義) R入門で使うRスクリプトおよびサンプルデータ(csvファイル)
学会(第64回日本生態学会全国大会)発表のスライド(日本語)
miki_esj64_jpn_final.pptx