По окончании университета он был направлен на работу в бальнеологическое отделение для больных с заболеваниями периферической нервной системой, где работал по специальности невропатолога. В 1928 - 1929 гг. он дважды проходил стажировку в институте усовершенствования врачей в Ленинграде под руководством профессора Л.В. Блюменау. Осенью в 1930 году Е.А. Успенский был зачислен на должность ординатора неврологического отделения больницы им. И.И. Мечникова, которое возглавлял известный научный работник M.И. Асвацатуров. С этого времени начинается научная деятельность Е.А. Успенского. В 1939 г. он опубликовал первую научную работу «К вопросу о лечении цереброспинального эпидемического менингита». В этом же году он переходит на работу в Институт экспериментальной медицины в лабораторию нормальной и патологической морфологии нервной системы, которой руководил выдающийся патолог Б.С. Дойников. В 1935 году Евгений Александрович на зассдании Ученого Совета под руководством выдающегося физиолога И.П. Павлова доложил выполненную им работу на тему «О топографическом делении гистопатологичних изменений в нервной системе человека при уличном бешенстве». Члены Совета высоко оценили этот доклад, и Евгению Александровичу была присуждена научная степень кандидата медицинских наук без защиты диссертации. 

В последующем Евгений Александрович работает на кафедре патологической анатомии Института усовершенствования врачей под руководством профессора Ф.М. Чистовича и В.Г. Гаршина где он запланировал докторскую : диссертацию на тему «Метастазирования рака разных opганов в нервную систему». 

В 1939 году он был призван в ряды Красной Армии и к началу войны с бело-финами выступает как военный прозектор и руководит специальной группой этих специалистов на Карельском фронте. По окончании боевых действий с белофиннами Е.А. Успенский переведен на должность старшего преподавателя кафедры патологической анатомии Военно-медицинской академии им. С.М. Кирова. 

С первых дней Великой Отечественной войны Е. А. Успенский был назначен заместителем начальника, а затем начальником патолого-анатомической лаборатории Ленинградского фронта. Здесь, в условиях блокады, голода, артиллерийских обстрелов и авиабомбардировок Евгений Александрович начал свою работу но огнестрельным ранениям. Однако, невзирая на тяжелые условия блокады, он не оставляет мысли о теме своей докторской диссертации и такой ее важный раздел как «Диффузные метастазы рака в нервной системе» в феврале 1943 года публикует в журнале «Экспериментальная невропатология» (Чикаго, США). 

В 1941 г. Евгений Александрович проводит в условиях прозекторской работы на Западном, Белорусском и I Украинском фронтах, где собрал большую коллекцию уникальных препаратов огнестрельных ранений. 

28 ноября 1942 года Ставкой Верховного командования Красной Армии был дан приказ относительно организации военно-медицинского музея, где полностью должна была быть отображена работа медиков в годы Великой отечественной войны. 

Ответственными за организацию музея были назначены корпусный врач, начальник Главного медицинского управления Ефим Иванович Смирнов, генерал-лейтенант Виктор Николаевич Шевкуненко и профессор Алексей Николаевич Максименков. С начала музей дислоцировался в г. Москве, где была организована доставка самых разнообразных препаратов и материалов медицинской службы по отдаленным боевым операциям, новейшие методы, принятые для массового лечения раненых и больных воинов. 

В организации музея был также предусмотрен специальный отдел но разработке музея патолого-анатомических материалов, которые поступают с фронтов и от отдельных армий. Начальником отдела в январе 1944 года был назначен Евгений Александрович. Здесь он проработал 10 лет. 

В стенах музея он сосредоточил свою огромную коллекцию патолого-анатомических препаратов огнестрельных ранений в разных сроках, начиная от поля боя и заканчивая поздними осложнениями боевой травмы. Коллекция была уникальной как за количественным составом, так и за многообразием патологоанатомических картин. Нужно было все описать и систематизировать. 

Евгений Александрович начал оформления на каждый препарат паспорта и необходимой каталогизации. В целом были собраны до конца войны около 6 тысяч препаратов, которые в настоящий момент сохраняются в Военно-медицинском музее (Санкт-Петербург, Лазаретный 1 пер., 2). 

В дальнейшем к работе была привлечена группа выдающихся художников, которые с натуральных препаратов : создали уникальные медицинские рисунки. Эти рисунки, в количестве 500, и послужили основными иллюстрациями для многотомного труда «Опыт Советской медицины в Великой Отечественной войне 1941- 1945 гг.». Евгений Александрович, по предложению редактора IV тома академика Владимира Николаевича Шамова, изложил основы патологической анатомии огнестрельных ранений головного мозга. А академик Александр Николаевич Бакулев - редактор XI тома - пригласил Евгения Александровича изложить патологическую анатомию огнестрельных ранений позвоночника и спинного мозга. 

Выполняя такое ответственное задание, Евгений Александрович не забывал и о своей докторской диссертации, которую удачно защитил в апреле 1953 года под названием «О метастазах рака в нервную систему». В 1956 году Евгений Александрович был избран на должность заведующего кафедры патологической анатомии Одесского медицинского института им. Н.И. Пирогова. 

Е.А. Успенский опубликовал 55 научных трудов, среди которых исследования из военной патологии и труды морфологического характера, посвященные изменению нервной системы при раке, патологической анатомии эпилепсии (Руководство из неврологии, т. VI), некоторым вопросом патогенеза атеросклероза, патологической морфологии аппендицита, холецистита и язвенной болезни у лиц преклонных лет. Кроме того, Е.А. Успенским совместно с П.В. Сиповским издан учебник по патологической анатомии для студентов стоматологического факультета. За этот период сотрудниками кафедры и другими учениками под его руководством выполнено 120 научных трудов; защищено 18 кандидатских и 3 докторских диссертации. 

Владея большим педагогическим мастерством и опытом, высокой эрудицией и творческой инициативой, Евгений Александрович постоянно уделяет внимание усовершенствованию учебного процесса. Е.А. Успенский много лет был областным патологоанатомом, в течение 18 лет бессменно избирался председателем Одесского научного "Общества патологоанатомов, членом редакционного Совела журнала «Лечебное дело», принимал активное участие В работе отечественных и международных конгрессов, съездов, конференций, симпозиумов. 

Наряду с работой и руководством Одесским научным обществом патологоанатомов, Евгений Александрович с 1956 г. был членом Одесского научного общества невропатологов и психиатров, где он активно участвовал в работе, выступая с докладами и сообщениями но вопросам сосудистой патологии головного мозга, инфекционных заболеваний нервной системы, в том числе н ботулизма. Ознакамливал членов общества с новыми данными о метастазировании опухолей в нервную систему, сделал интересные сообщения о роли нервной системы в геронтологических проблемах. 

Евгений Александрович в своих научных трудах уделял очень большое внимание изучению патоморфологии нервной системы при различных ее поражениях. 

Он был близок и дружил с выдающимися неврологами в свое время С.Г. Давиденковым, И.Я. Раздольским, Б.И. Шараповым, Д.И. Панченко и многими другими. 

Евгений Александрович награжден 10 орденами и медалями, знаком «Отличник здравоохранения». Многочисленные ученики, сотрудники, студенты, все, кто знал Е.А. Успенского, уважают его большой труд, ценят его неизменную доброжелательность, чуткость, создаваемую им обстановку взаимного понимания и уважения, постоянное стремление к новому, передовому. 

На V Всесоюзном съезде патологоанатомов Евгений Александрович был избран почетным членом Всесоюзного научного общества патологоанатомов, где ему был вручен почетный диплом. 

С сентября 1973 года Евгений Александрович находился на заслуженном отдыхе. 

Евгений Александрович был любимцем студентов, хлебосольным хозяином и прекрасным собеседником. Его рассказы о встречах с интересными личностями, в частности из У. Пенфилдом, которого он принимал в Ленинграде в своей лаборатории, с ректором Московского Государственного университета академиком А.Я. Вышинским, выдающимся патологоанатомом А.И. Абрикосовым и многими другими, оставляют неизгладимое впечатление. 

Евгений Александрович очень любил природу, лес охоту, животных; был музыкальным человеком, люби; Бетховена и сам хорошо музицировал на виолончели; знал и любил литературу, особенно российскую классику; щедро дарил «роскошь человеческого общения» студентам и сотрудникам. 

Профессора и преподаватели Одесского медицинского университета, среди которых много, кто в прошлом были слушателями Евгения Александровича, его многочисленные ученики и сотрудники кафедр - все кто его знал, помнят его большую доброжелательность, созданную им обстановку взаимного понимания и уважения. 

Умер Евгений Александрович Успенский после тяжелой болезни 31 января 1977 года и был похоронен с воинскими почестями в Одессе на центральной аллее 2-го Христианского кладбища в непосредственной близости от Дмитриевской церкви. 

Жизнь Евгения Александровича - пример самоотверженного служения Отчизне и медицинской науке. 

Профессор А. Г. Попов, доцент А. П. Коваленко, кандидат наук В. В, Десятский