Процесс научного образования в Императорском университете Варшавского университета в основном регулировался «указаниями свыше», то есть с использованием министерских распоряжений. Важное значение имело постановление министра народного просвещения от 30 июня 1873 г. о допуске к защите диссертаций на соискание высших ученых степеней в Варшавском университете только тем, кто сдал экзамен в Варшавском университете. В отступление от этого распоряжения необходимо было специальное разрешение Министерства народного просвещения. Например, Николай Чижов, подавая заявку на получение степени магистра на юридическом факультете в 1881 году, сдал магистерский экзамен в Киевском Университете. Владимир Качановский, подавший заявку на поступление в магистратуру на историко-филологический факультет, сдал магистерский экзамен в Санкт-Петербургском университете. Чижову и Качановскому было разрешено защищать магистерскую диссертацию по специальному разрешению министра. Это положение было неудобным, поскольку ограничивало и без того малый процент тех, кто подавал заявления на получение высших научных степеней в Императорском Варшавском университете. Поэтому 28.02.1902 года это постановление было отменено министром.