En los CEPER y SEP se pueden impartir asimismo otros planes. El procedimiento para solicitar su autorización a la Consejería de Educación, Cultura y Deporte de la Junta de Andalucía se indica en la instrucción SEGUNDA, solicitud de "otros planes educativos", y el formulario a cumplimentar aparece en el Anexo de las INSTRUCCIONES de 14 de mayo de 2009. A pesar de que estas Instrucciones estaban referidas para el curso académico 2009/2010, las han ido prorrogando año tras año.