Embedded Files
http://ru.wikipedia.org/wiki/ShRNA Последнее изменение этой страницы: 13:45, 20 октября 2009.
ShRNA
ShRNA
[править]
Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (shRNA — short hairpin RNA, small hairpin RNA) — молекулы коротких РНК, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения экспрессии генов путем РНК-интерференции. Короткие РНК, образующие шпильки, вводят в клетки при помощи вектора, использующего промотор U6, для обеспечения конститутивной экспрессии. Такой вектор, как правило, передается дочерним клеткам и обеспечивает наследуемое выключения гена.[1]
Структура малых РНК, образующих шпильки, разрезается клеточными ферментами в малые интерферирующие РНК (siRNA), которые далее переходят в РНК-индуцируемый комплекс выключения гена (RISC). Этот комплекс связывается и разрезает мРНК, участки которых комплементарны siRNA.
Малые РНК, образующие шпильки, транскрибируются РНК полимеразой III. Образование shRNA в клеткахмлекопитающих иногда вызывает интерфероновый ответ, для защиты клетки, как в случае вирусной атаки. Такие процессы не наблюдаются в случае miRNA (микроРНК), которые транскрибируются РНК полимеразой II.[2]
Малые РНК, образующие шпильки, также используются и у растений. но в таком случае, не используют промотор U6. В растениях обычно используют традиционный промотор, обеспечивающий конститутивную экспрессию, — CaMV35S из вируса мозаики цветной капусты (англ. cauliflower mosaic virus 35S promoter).[3]
[править]
Примечания
Примечания
- ↑ Paddison P, Caudy A, Bernstein E, Hannon G, Conklin D (2002). "Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells". Genes Dev. 16 (8): 948–58. DOI:10.1101/gad.981002. PMID 11959843.
- ↑ Cao W, Hunter R, Strnatka D, McQueen C, Erickson R (2005). "DNA constructs designed to produce short hairpin, interfering RNAs in transgenic mice sometimes show early lethality and an interferon response". J. Appl. Genet. 46 (2): 217–25. PMID 15876690.
- ↑ McIntyre G, Fanning G (2006). "Design and cloning strategies for constructing shRNA expression vectors". BMC Biotechnol. 6: 1.DOI:10.1186/1472-6750-6-1. PMID 16396676.
Категории: Эпигенетика | РНК-интерференция | РНК
http://en.wikipedia.org/wiki/Small_hairpin_RNA This page was last modified on 8 December 2009 at 05:20.
Small hairpin RNA
Small hairpin RNA
From Wikipedia, the free encyclopedia
A small hairpin RNA or short hairpin RNA (shRNA) is a sequence of RNA that makes a tight hairpin turn that can be used to silence gene expressionvia RNA interference. shRNA uses a vector introduced into cells and utilizes the U6promoter to ensure that the shRNA is always expressed. This vector is usually passed on to daughter cells, allowing the gene silencing to be inherited. The shRNA hairpin structure is cleaved by the cellular machinery into siRNA, which is then bound to the RNA-induced silencing complex (RISC). This complex binds to and cleavesmRNAs which match the siRNA that is bound to it.
shRNA is transcribed by RNA polymerase III. shRNA production in a mammalian cell can sometimes cause the cell to mount an interferon response as the cell seeks to defend itself from what it perceives as viral attack. This problem is not observed in miRNA, which is transcribed by RNA polymerase II (the same polymerase used to transcribe mRNA).
shRNAs can also be made for use in plants and other systems, and are not necessarily driven by a U6 promoter. In plants the traditional promoter for strong consitutive expression (in most plant species) is the cauliflower mosaic virus 35S promoter (CaMV35S), in which case RNA Polymerase II is used to express the transcript destined to initiate RNAi.
References
References
- McIntyre G, Fanning G (2006). "Design and cloning strategies for constructing shRNA expression vectors". BMC Biotechnol. 6: 1. doi:10.1186/1472-6750-6-1. PMID 16396676.
- Harper S, Staber P, He X, Eliason S, Martins I, Mao Q, Yang L, Kotin R, Paulson H, Davidson B (2005). "RNA interference improves motor and neuropathological abnormalities in a Huntington's disease mouse model". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (16): 5820–5. doi:10.1073/pnas.0501507102. PMID 15811941.
- Nielsen M, Pedersen F, Kjems J (2005). "Molecular strategies to inhibit HIV-1 replication". Retrovirology 2: 10.doi:10.1186/1742-4690-2-10. PMID 15715913.
- Paddison P, Caudy A, Bernstein E, Hannon G, Conklin D (2002). "Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells". Genes Dev. 16 (8): 948–58. doi:10.1101/gad.981002. PMID 11959843.
- Cao W, Hunter R, Strnatka D, McQueen C, Erickson R (2005). "DNA constructs designed to produce short hairpin, interfering RNAs in transgenic mice sometimes show early lethality and an interferon response". J. Appl. Genet. 46(2): 217–25. PMID 15876690.
Lentiviral Delivery of designed shRNA's and the mechanism of RNA interference in mammalian cells.
Page updated
Google Sites
Report abuse