分子遺傳學

何謂「PCR」?

PCR (polymerase chain reaction)，為模仿細胞內DNA 複製過程，將欲檢測的DNA片段多次複製，使其更易被檢測與判讀。

PCR 總共分為三個階段: Denaturation (將DNA雙股分離)、 Annealing (接引子)、 Extension (延長DNA)。而這三個階段中，會利用溫度的調整以利反應進行。這三個步驟通常會進行20~40個循環，以將DNA片段複製至合適的數量。

PCR 的反應過程中，會用到的原料有:

與胞內DNA複製不同，DNA複製中所用引子為RNA primer，但PCR中所用引子為DNA primer。且DNA複製中是利用解旋酶分開兩股，但PCR中會直接利用溫度破壞鹼基上氫鍵。

在容器中加入 Agarose (瓊脂糖凝膠)以及 TBE buffer，並利用微波加熱使agarose 溶於 TBE buffer。加入 SafeView (DNA dye) 搖晃均勻後倒入凝膠托盤，插入 comb 後等至其冷卻凝固。

利用帶電粒子在電場作用下會朝電性相反的電極移動之原理，讓帶負電的DNA分子在電場中往正極移動。而凝膠的功能則是因為凝膠中有許多類似篩網的空隙，可以阻止大分子 DNA 前進，使得不同長度片段的 DNA 在不同位置停下。最後再以UV激發 DNA dye，便可判讀所複製之 DNA 長度。

※ DNA形狀也會影響電泳速率: 同分子量狀況下，超螺旋＞環狀＞線狀。

實驗設計

利用CHD primer 與 CAUD006 primer 複製其性染色體與微衛星DNA片段，判斷其性別與親緣關係。

北京鴨原產於華北地區，後在美國被選育成純白色的羽毛，體型也更為碩大。

土番鴨通常泛指由公番鴨與菜鴨、北京鴨或改鴨母鴨（北京鴨公鴨與母菜鴨雜交產生的後代）雜交所產生的後裔。

番鴨以面部的紅色肉疣為主要特徵。

由左而右第一至四條為加入CHD primer之sample，第五條為Marker，第六至九條為加入 CAUD006 primer 之 sample。

其中第1、6組中添加的為 Pekin duck DNA ;

第2、7組中添加的為 Mule duck DNA ;

第3、8組中添加的為 Muscovy duck DNA ;

第4、9組中添加的為 ddH₂O，用於做為負對照組。

一、CHD primer 組

鴨子的性別系統與人類不同，為ZW系統。其中ZZ代表雄性，ZW代表雌性。上圖中一到四組的2條線由上到下分別代表Z與W性染色體序列，因此可以判斷此次實驗中，北京鴨與番鴨的性別均為雌性，而土番鴨為雄性。

二、CAUD006 primer 組

由於土番鴨的 DNA 序列為北京鴨和番鴨的綜合體，因此我們判斷實驗中的土番鴨可能為北京鴨與番鴨之雜交體。

三、誤差討論

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