昭和24年（1949）調剤学講座として創設される。
昭和29年（1954）調剤学講座が調剤学講座と製剤学講座に分かれる。
昭和39年（1964）調剤学講座から薬剤学講座に改称される。
平成2年（1990）分子生物学研究室が開講。林 恭三 教授（第4代教授）が初代教授として異動される。
平成9年（1997）臨床薬剤学研究室が開講。足立 哲夫 助教授が初代研究室主任として異動される（2003年、同 教授に就任）。
平成25年（2013）薬剤学研究室から薬物動態学研究室に改称される。
現在に至る。
初代（1st）（1949-1953） 宮道 悦男 教授（Prof. Etsuo MIYAMICHI）（初代学長、1st President, 1949-1966）
第2代（2nd）（1953-1976） 加藤 好夫 教授（Prof. Yoshio KATO）
第3代（3rd）（1977-1983） 杉浦 衛 教授（Prof. Mamoru SUGIURA）（第5代学長、5th President, 1981-1983）
第4代（4th）（1984-1990） 林 恭三 教授（Prof. Kyozo HAYASHI）
第5代（5th）（1991-2013） 平野 和行 教授（Prof. Kazuyuki HIRANO）
第6代（6th）（2013-current）北市 清幸 教授（Prof. Kiyoyuki KIATICHI）