SDS-PAGE:十二烷基硫酸鈉聚丙烯醯胺凝膠電泳
為變性的蛋白質電泳,依分子量分離出不同大小的蛋白質
透過SDS破壞蛋白質二級結構並讓蛋白質統一帶負電
以酒精擦拭玻璃片及鋁片
放置方向為玻璃朝外,鋁片朝內,中間留孔隙
將交台組裝後,以洗瓶測試(防止漏膠)
測試完成,將水倒掉並以長圖畫紙擦乾
H₂O:4.6ml
29%* Acrylamide Mix:2.7ml *成膠的基本單位*
1.5 M Tris (pH8.8) :2.5ml *維持溶液的電中性及pH*
10% SDS:100μl *界面活性劑*
TEMED:6μl *幫助傳遞自由基的催化劑*
1% TCE (2,2,2-Trichloroethanol) :100μl *膠體染色*
10%* Ammonium Persulfate (APS):100μl *自由基的提供者*
上述材料依序加入離心管中 *10% APS 一定要最後,加入後膠體會開始凝固*
以pipetman吸取配置好的running gel加入玻璃片與鋁片之間
加到約一半再多一些後停止,剩餘空隙緩慢以水填滿
待running gel凝固後,將水倒掉
以短圖畫紙吸乾水
* Acrylamide
為一種分子量極小的物質,分子與分子間為連結實為神經毒,易從皮膚滲入體內。操作時須配戴手套
常溫時不凝固
* Ammonium Persulfate (APS)
為一種催化劑
可連結acrylamind分子使其凝固
H₂O:3.4ml
29% Acrylamide Mix:830µL
1.0M Tris(pH6.9):630µL
10% SDS:50µL
TEMED5:µL
10% Ammonium Persulfate:50µL
將上述材料依照順序加入離心管中
期間離心管請至於冰上
用pipetman吸取配置好的stacking gel加入上一過程吸乾水的空間
*加入的速度不能太快,避免衝破下膠
上膠加滿後插入齒書(盡量不要有氣泡)
於室溫靜待電泳膠凝固30-60分鐘後,即可開始跑膠實驗
先將配置好的膠連同鋁片以及玻璃片從膠台上取下
於水槽邊操作,把齒書拆下來 *過程須持續沖水*
拆下來之後加水至well中,把氣泡沖乾淨
用夾子將膠體組夾於電泳槽內(同樣玻璃朝外鋁片朝內)
另一側再以一片玻璃夾住
加入約300ml的1X running buffer
玻璃與電泳槽空隙部分用滴管填滿buffer
填滿完buffer以後
以pipetman在well裡加入以下蛋白質:
BSA (牛血清白蛋白)
casein (酪蛋白)
蛋白質Marker
dye
loading完成好後即可開始跑膠
將電泳槽與電源供應器連接
初始的30分鐘電壓調製90V
當膠跑至下膠處,將電壓調整至170V
當dye跑至底下buffer時則可停止跑膠
當跑完膠後,將夾子拆除 *過程中全程保持膠體濕潤以免膠體破裂*
使用鏟子將玻璃和鋁片分離,膠體會黏在其中一片上
用鏟子把上方多餘膠體切除
下方則輕易刮起,放置於水盆中 *同樣保持濕潤*
最後移至UV box拍取影像
跑完之後的蛋白質電泳影像分為兩種
為可見光底下可看見的蛋白質marker
為UV照射下的蛋白質影像圖
經比對後可以做出以下excel圖表