ประโยชน์ของน้ำผึ้งช่วยรักษาโรคได้หลายอย่างดังที่บอกไป ทว่าข้อควรระวังในการบริโภคน้ำผึ้งก็มีมาแนะนำกันด้วย ดังนี้

- ไม่ควรให้เด็กอายุต่ำกว่า 1 ขวบ กินน้ำผึ้ง เนื่องจากในน้ำผึ้งมีทั้งเอนไซม์ น้ำลายจากตัวผึ้ง เด็กอาจมีภูมิต้านทานไม่พอจนทำให้เกิดอาการอาเจียนหรือท้องเสียได้

- ไม่ควรกินน้ำผึ้งเกินวันละ 10 ช้อนชา เพราะอย่าลืมว่าน้ำผึ้งก็เป็นน้ำตาลชนิดหนึ่ง ซึ่งอาจทำให้ระดับน้ำตาลในเลือดสะเทือนได้ โดยเฉพาะผู้ที่ป่วยเป็นโรคเบาหวานอยู่แล้ว