Existen procesos bioquímicos y modificaciones morfológicas que cambian sustancialmente la eficacia del ciclo fotosintético afectando el crecimiento de las plantas.
Este es el metabolismo que hemos visto hasta ahora. Las plantas C3 tienen una anatomía foliar típica y realizan el Ciclo de Calvin sin modificaciones.
Las plantas C4 presentan anatomía Kranz. La primera fijación del CO2 produce un compuesto de cuatro carbonos que le da el nombre al metabolismo.
Las plantas CAM son las más eficientes en el consumo de agua. También fijan el CO2 en un compuesto de cuatro carbonos y se caracterizan por acumular ácido en la noche.