A partir del año 1998, se da comienzo a la implementación de un nuevo nivel en la institución, como fuera el Tercer Ciclo de la Educación General Básica.
Con posterioridad, y luego de un trabajo sobre la Ley Nacional de Educación y una asamblea de socios, se incorpora a partir de 2009 el nivel Polimodal, de manera tal de dar una respuesta a la población juvenil y sus familias, contando así con una oferta de Educación Secundaria completa en la Escuela Mutualista.
Al proyectar las características de los egresados de un nivel educativo como es el secundario, se hace necesario volver a mirar con atención las funciones que son propias de este nivel de la educación
En este sentido, se deberá propender a una sólida formación de los y las estudiantes en los diferentes campos del saber con el fin de que puedan continuar estudios en un nivel superior. Al mismo tiempo, esta formación debe brindarles las herramientas necesarias para enfrentarse a situaciones diversas desde una posición informada con el fin de buscar las soluciones acordes.
Personas críticas, que cuenten con una visión transformadora de la realidad en que se encuentren.
Comprometidos con la vida democrática.
Capaces de buscar alternativas y tomar decisiones fundadas ante situaciones que se les presenten.
Interesados en la formación continua, que les permita emprender estudios en otros niveles como así también para su formación laboral.
Capaces de valorar el esfuerzo y el trabajo constante para el logro de sus propósitos.
Interesados por la lectura y la escritura de textos de diversos géneros.
Formados en aspectos cognitivos, creativos, físicos y expresivos, que les permitan una formación integral.
Ejercitados en la discusión que favorece la relación entre conceptos y la construcción de conocimientos.
Capaces de expresar ideas, opiniones y posturas personales de manera fundamentada y respetuosa.