En el municipio se presenta la transición de los climas templados de la Sierra Norte, a los cálidos del declive del Golfo, se presentan dos climas: clima templado húmedo con abundantes lluvias en verano, temperatura media anual entre 12 y 18º C; temperatura del mes más frío entre -3 y 18ºC; precipitación pluvial del mes más seco menor de 40 milímetros; precipitación pluvial invernal con respecto a la anual mayor de 5 por ciento. Se presenta al sur y occidente. clima semicálido subhúmedo con lluvias todo el año; temperatura media anual mayor de 18º C; temperatura del mes más frío entre -3 y 18ºC; precipitación pluvial del mes más seco mayor de 40 milímetros; lluvia invernal con respecto a la anual menor de 18 por ciento. Se localiza en la porción oriental.
En su territorio se presenta un solo tipo de suelo:
Luvisol: Son suelos ricos en nutrientes; con horizonte cálcico o presencia de material calcáreo por lo menos en la superficie. Son de fertilidad moderada a alta. Presenta fase lítica profunda (roca entre 50 y 100 centímetros de profundidad).
Respecto a la flora el territorio ha perdido la mayor parte de su vegetación original; aún conservan, sin embargo, algunas zonas de asociaciones boscosas de pino-encino o meso filo de montaña que bordean el municipio, o en la sierra que se levanta al centro del mismo. Las grandes áreas que han sido deforestadas han sido incorporadas al cultivo de maíz, frijol y café.
También hay árboles frutales como la guayaba, naranja, durazno, pera, mora, nuez, mandarina, pera mora, limón, papaya, granada, plátano macho, plátano pera, plátano tampico, naranjas, zapote negro y blanco, e higo.
Asimismo hay verduras como frijoles, maíz, papas, jitomate, tomate, café, cilandro, elote, zanahoria, chile, , epazote, manzanilla, hierva buena, calabaza, chayote, espinoso, perejil, epazote de zorrillo, ruda, capoltomatl, col, rábano, nopal, ajo, jengibre, chile manzana, hongos y chiltepín.
Existen árboles de ocote, elite, matlawuajkal, trueno, olivo, palmeras, bambú, pinos, sácate, hay otros que podrían lastimarte como el tsitsicastli o conocida como hierba mala, solo hay esa variedad en este municipio que está rodeado de toda la naturaleza hermosa y sabia.
En cuanto a la fauna hay un sin fin de especies que como lo son las ardillas, coyotes, conejos, palomas, zorros, zorrillos, halcones, venados, temazates, búhos, colibrís, murciélagos, tejones, ranas, lagartijas, mapaches, víboras de cascabel, colarillo, mamba negra y filipina, arañas, mariposas, pájaros, borregos, camarones, pollos, gatos, perros, puercos, borregos, ratones, zopilotes, lechuzas, onzas o comadrejas, armadillos, charales, pericos, escorpiones, urracas, tlacuaches, patos, gallaretas, zencoatas, chirrioneras, insectos, moscas y tigrillos.
La mayoría de estos animales hermosos viven en el campo que es su habitad principal donde duermen en los árboles, debajo de la tierra que cavan sus hoyos, en piedras, madrigueras, en el pasto y en las cuevas, porque ahí encuentran de que alimentarse ya sea de bellotas, hiervas, carne de otros animales que cazan, frutas, vegetales, etc.
Los animales acuáticos viven en los ríos del municipio y sus alrededores, estos se alimentan de los charales, ranas, moscas y hiervas que crecen en el agua.
Existen animales domésticos como lo son los perros, gatos, gallinas, gallos, pollos, puercos, borregos, vacas y toros que viven en casas de sus dueños donde los alimentan de croquetas, wiskas, maíz, pasto, hiervas como lengua de vaca y agua, después de un tiempo de alimentarlos los consumen a excepción de gatos y perros.
Esas son las especies que viven en el municipio y que gracias a ellas tenemos una gran diversidad tanto en flora y fauna.