서울대학교병원 의생명정보학 연구실

Medical & Health Big Data Research

CDM 구축 및 운영

- - 서울대학교병원 CDM 구축 및 운영

- 2017년 10월 구축을 시작하여 서울대학교병원 EMR 데이터를 OMOP CDM으로 변환하고 지속적으로 업데이트하고 있음. (2026년 10월 기준, 2025년 12월까지 내원 이력이 있는 환자 약 390만 명)

- Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) Common Data Model (CDM)이란? https://www.ohdsi.org/data-standardization/

- 전세계 OMOP CDM 변환 현황: 2019_data_network

- - 내원, 진단, 처치·수술, 약물, 의료기기, 검사결과 및 기록지 정보를 제공하며, SUPREME와 연계하여 연구자의 데이터 활용을 지원함.
  - 운영 자동화: Airflow 기반으로 CDM 전체의 메타데이터 추출, 가명화 및 CDM 테이블 생성을 자동화하고 있음.

멀티모달 데이터 확보 및 Extended CDM 구축

- - 현재 심전도, 흉부 X선 및 병리 데이터를 확보하고 CDM 연계를 확대하고 있음.

- 심전도 (ECG) XML [ 2004.10~2025.12] : 약 387만건 / 119만명

- 근전도 (EMG) [ 2010.08~2024.11 ] : 약 2.2만건 / 1.5만명

- NICU Vital [ 2021.06~2025.12 ] : 약 100만건/ 1,811명

- PICU Vital [ 2020.10~2025.12 ] : 약 57만건 / 3520명

- 수술장 Vital [ 2022.01~2025.12 ] : 약 11만건 / 8만명

- 심전도(ECG) DICOM [ 2004.10~2022.06 ] : 약 312만건 / 104만명

- 흉부 X선(CXR) DICOM [ 2004.10~2024.12 ] : 약 717만건 / 124만명

- 병리 데이터 (테이블) [ 2002.12~2022.05 ] : 약 1만건 / 842명

- - 생체신호 : Holter, 운동부하검사(TMT) 등의 수집·변환을 추진 중임.
  - 유전체 : ALS 유전자 패널 검사 데이터와 변이 정보를 CDM에 연계하는 구축을 추진 중임.

소아CDM 구축 및 활용

- - 현재 소아 임상정보에 영상, 생체신호 및 기록지를 연계하는 CDM을 구축하고 있음

- 심전도 (ECG) XML : 약 36만건 / 15.4만명

- 심전도(ECG) DICOM : 약 31만건 / 13.5만명

- 흉부 X선(CXR) DICOM : 약 91만건 / 18.8만명

- NICU Vital : 약 100만건/ 1,811명

- PICU Vital : 약 53만건 / 3,148 명

- - 소아 심초음파 영상의 전기간 수집과 판독문 연계를 진행하고 있으며, NICU·PICU 생체신호 등으로 데이터 범위를 확대 중임.
  - ECG, CXR, VitalDB 및 NICU 퇴원기록지를 활용한 연구를 추진하고, 소아 CDM 홈페이지를 구축중임.

소아CDM 구축 및 활용

- - 간호기록지: CDM Note에 입원간호정보, 간호일지, 퇴원간호기록, CPR기록, 낙상위험도평가기록정보, 욕창평가기록, 욕창기록, 응급환자 진료내역(환자 중증도 분류), 전과전동간호기록, 임상관찰기록을 우선 적재 중임 (2004년~2025년, 약 32억 건)

- 반정형 간호진술문: 간호일지의 간호진술문 중 원내 누적 사용 빈도의 60% 이상을 차지하는 상위 진술문과 약물부작용·환자 상태 악화 관련 진술문을 선별하여 표준용어 매핑을 진행함(진술문(Entity) 기준 140개, 진술문–속성–속성값(EAV) 조합 기준 1,544개

- - 심초음파, 폐기능검사 및 퇴원기록지 적재되었으며, 마취기록지 이관 추진 중임.
  - 퇴원기록지에서 약물부작용 관련 정보를 추출하는 NLP 연구 진행 중임.

소아CDM 구축 및 활용

- - 다기관 공동연구 협력체계: 4개 병원 협의체, MOA CDM, MDV CDM.
  - 서울대학교병원, 분당서울대학교병원, 서울아산병원 및 가톨릭대학교병원의 4개 병원 협의체를 통해 CDM 공동연구를 지속적으로 진행 중임.
  - 면역관문억제제(ICI), 심초음파 등 임상 주제의 공동연구와 데이터 표준화 협력을 추진하고 있음.

CDM 관련 수행(참여) 중인 정부 과제들

- - 한국연구재단, 딥러닝을 이용한 영상/빅데이터 기반 골절 예측 모델 개발, 2020.03.01 ~ 2022.12.31
  - 산업통상자원부, CDM 기반 정밀의료 데이터 통합 플랫폼 기술개발사업, 2019.04.01 ~ 2022.12.31
  - (종료) 보건복지부, 개인정보보호 강화 DisTIL (Distributed Transfer-Iterative Learning) 알고리즘 개발, 2019.07.25 ~ 2021.12.31
  - (종료) 보건복지부, OMOP CDM에서의 데이터 품질 측정, 보안 분산연구 플랫폼 및 임상시험에의 확장모델, 2019.04.01 ~ 2021.12.31
  - (종료) 산업통상자원부, 사용자 편의성이 고도화된 CDM 기반 스마트 임상시험 설계지원 시스템, 2019.05.01 ~ 2021.12.31
  - (종료) 보건복지부, 공통데이터모델을 이용한 의료방사선 노출이 2차 암 발생에 미치는 영향 연구, 2019.04.01 ~ 2021.12.31

보건의료 빅데이터 관련 수행(참여) 과제들

- - 과학치안진흥센터(경찰청 과제), IoT, AI 기반 경찰 인적자원 항상성 관리 플랫폼 개발사업, 2022.04~2026.12
  - 식품의약품안전처, 인공지능기반 의료용 마약류 오남용 예측 모델 개발연구, 2026.01~2027.12
  - (종료) 한국보건산업진흥원, 신이식 수혜자 및 공여자의 맞춤형 의료 서비스 제공을 위한 지침 개발, 2018.08 ~ 2021.04
  - (종료) 한국보건의료연구원, 빅데이터 신장 이식 연구생체 신장 공여자의 안전을 위한 의료 관리 지침 개발
  - (종료) 한국보건의료연구원, 골감소증 환자에서 골절 예방 치료의 필요성 연구