News
2024年度
論文発表(2024. 4. 29): 論文がPhysical Review ResearchのLetterとして公開されました。
Masashi K. Kajita, Yoshiyuki Konishi, Tetsuhiro S. Hatakeyama*, Active thermodynamic force driven mitochondrial alignment, Physical Review Research, 6, L022024, (2024) https://doi.org/10.1103/PhysRevResearch.6.L022024.
東京大学と福井大学の合同でプレスリリースを行いました。
2023年度
研究会開催&研究発表(2024. 1. 6-7):定量生物学の会 第11回年会を東京大学生産技術研究所で開催しました。またポスター発表も行いました。
研究発表(2023. 9. 21):新学術領域「情報物理学でひもとく生命の秩序と設計原理」領域会議にて「神経軸索内ミトコンドリアによる等間隔パターン形成」というタイトルで発表を行いました。
研究発表(2023. 9. 6):2023年度日本数理生物学会にて「Active thermodynamic forceによる擬似斥力を利用した細胞内オルガネラの移動と配置」というタイトルで発表を行いました。また指導学生1名がポスター発表を行いました。
研究発表(2023. 8. 22):福井大学ライフサイエンスイノベーションセンター研究交流会にて「Active thermodynamic forceによる擬似斥力を利用した細胞内オルガネラの整列」というタイトルで発表を行いました。また指導学生1名も口頭発表を行いました。
研究発表(2023. 8. 12):国際会議 Collective Phenomena in complex systems: problems inspired by Ecology and Evolution (CoPhEE2023)にて「Active thermodynamic force driven mitochondrial alignment 」というタイトルでポスター発表を行いました。
研究発表(2023. 8. 7):国際会議 28th International Conference on Statistical Physics (Statphys28)にて「Noise-induced receptor clustering as a functional role of noise for reducing errors in target ligand detection」というタイトルでポスター発表を行いました。
論文発表(2023. 5. 10): Preprint serverのarXivに下記の論文を公開しました。
Masashi K. Kajita, Yoshiyuki Konishi, Tetsuhiro S. Hatakeyama*, Active thermodynamic force driven mitochondrial alignment, Preprint at http://arxiv.org/abs/2305.05553 (2023).
研究室イベント(2023. 4. 1): 福井大学工学部物質・生命化学科の4年生2名、福井大学大学院産業創成工学専攻の修士課程1年生2名が新たにグループに加わりました。
2022年度
研究発表(2023. 3. 25):日本物理学会 2023年春季大会にて「Entropic forceに基づく細胞内オルガネラの移動」というタイトルで発表を行いました。
研究室イベント(2023. 3. 23): 学部4年生3名と修士課程の大学院生1名が卒業・修了しました。
研究発表(2023. 3. 21):第7回理論免疫学ワークショップにて「患者由来遺伝子発現量データからの疾患進行度推定とその応用」というタイトルで発表を行いました。
研究発表(2022. 12. 15):定量生物学の会 第十回年会にて「空間を考慮した転写ダイナミクスの数理モデリング」というタイトルでポスター発表を行いました。指導学生も1件ポスター発表を行いました。
論文発表(2022.10.13): npj Systems Biology and Applications 誌に論文が公開されました。慢性骨髄性白血病治療薬の効果を患者別に早期予測するデータ駆動型数理モデリングの手法を提案しました。
"Early Dynamics of Chronic Myeloid Leukemia on Nilotinib Predicts Deep Molecular Response", npj Systems Biology and Applications, 8, 39, 2022. https://doi.org/10.1038/s41540-022-00248-3 (Open Access)
東京大学、東京医科歯科大学、福井大学の合同でプレスリリース発表を行いました。
プレスリリース :数理モデルを用いた白血病治療薬の効果の患者別早期予測手法の提案
論文発表(2022.9.22):Cancers誌に論文が公開されました。細胞集団運動をとらえた動画データから1細胞ごとの軌道を取り出し、その細胞軌道を時系列クラスタリングすることで、集団内のリーダー細胞とフォロワー細胞を分類する数理解析手法を開発しました。"Time-Series Clustering of Single-Cell Trajectories in Collective Cell Migration", Cancers, 14 (19), 4587, 2022. https://doi.org/10.3390/cancers14194587 (Open Access)
研究発表(2022. 9. 15):日本遺伝学会第94回札幌大会のワークショップ「WetからDryへの挑戦」にて「生命医科学分野における数理・データサイエンス研究の始め方」というタイトルで発表を行いました。
研究発表(2021. 8. 24): 令和4年度 福井大学ライフサイエンスイノベーションセンター研究交流会にて「機械学習による多変量データからの生体ネットワーク推定」というタイトルで研究発表を行いました。また私たちの研究グループからM1の学生1名が研究発表を行いました。
研究室イベント(2022. 4. 1): 福井大学 工学部 物質・生命化学科の4年生3名が新たにグループに加わりました。
2021年度
研究室イベント(2022. 3. 23): 福井大学 工学部 物質・生命化学科の指導学生3名が卒業されました。うち1名は引き続き大学院に進学予定です。
研究発表(2022. 3. 14):第6回理論免疫学ワークショップ(2022/3/12~14, オンライン)にて「疾患ダイナミクスから慢性骨髄性白血病の治療効果を個別かつ早期に予測する」というタイトルの講演を行います(https://workshop.theoreticalimmunology.jp/6th-program/)。
論文公開(2022. 2. 17):Molecular and Cellular Neuroscience誌に論文"Intermitochondrial signaling regulates the uniform distribution of stationary mitochondria in axons"が公開されました (https://doi.org/10.1016/j.mcn.2022.103704)。福井大学の小西先生らとの共同研究で、ミトコンドリアが神経細胞の軸索内で等間隔分布する現象のメカニズムに実験と理論の両面から迫りました。本研究では、まず実験からミトコンドリア同士がATPを介して相互作用するという仮説を提案しています。私はその仮説を数理モデル化し、等間隔分布が生じる生理学的に妥当な条件が存在することをシミュレーションにより明らかにしました。これにより実験データから提唱された仮説を理論的に裏づけることができました。細胞内オルガネラの空間パターン形成に関する面白い実験・理論融合研究になったのではないかと思います。
研究発表(2021. 12. 21): 第39回 染色体ワークショップ・第20回 核ダイナミクス研究会にて「遺伝子上のRNAポリメラーゼ II 移動ダイナミクスの数理モデリングと実験データとの統合に向けた試み」というタイトルでポスター発表を行いました。
研究発表(2021. 9. 29): 令和3年度 福井大学ライフサイエンスイノベーションセンター研究交流会にて「個別化医療の実現に向けた疾患ダイナミクスのデータ駆動型数理モデリング」というタイトルで招待講演を行いました。
研究発表(2021. 9. 13): 日本数理生物学会2021年大会にて「Mathematical modeling of the spatial distribution of axonal mitochondria (軸索内ミトコンドリア空間分布の数理モデリング)」というタイトルで研究発表を行いました。
研究発表(2021. 8. 13): 合原・村上ムーンショット Projects 合同ワークショップにて「細胞内局在変化が生み出す免疫・神経機能への数理的アプローチ」というタイトルで研究発表を行いました。
2020年度
研究室イベント(2021. 3. 23): 福井大学工学部物質・生命化学科の指導学生2名が卒業されました。うち1名は引き続き大学院に進学予定です。
プレプリント公開 (2021. 2. 17):bioRxivに論文"Early Dynamics of Chronic Myeloid Leukemia on Nilotinib Predicts Deep Molecular Response"を公開しました(https://doi.org/10.1101/2021.02.17.431221)。
研究室website公開(2020. 8. 31):福井大学生物プロセス工学研究室のwebsiteをリニューアルしました。徐々にコンテンツを増やしていきます。http://acbio2.acbio.u-fukui.ac.jp/bioeng/process/
2019年度
異動:March, 2020. 東京大学 生産技術研究所 助教(合原一幸研究室)を退職し、福井大学 学術研究院 工学系部門 生物応用化学講座 助教に着任しました。工学部 物質・生命化学科 バイオ・応用医工学コースにおける教育を担当します。
論文採択:国際会議ICAROB 2020で発表した論文が国際誌JRNALにアクセプトされました。
Masashi K. KAJITA, (2020). An error correction mechanism for reliable chemical communication systems, The journal of Robotics, Networking and Artificial Life (JRNAL), 7 (1). (to be published) * This paper was presented at the 2020 International Conference on Artificial Life and Robotics (ICAROB 2020), and selected for the publication in JRNAL.
論文採択:細胞によるノイズ下での抗原識別メカニズムの理論モデルが国際誌Chaosに掲載されました。
Masashi K. Kajita, Kazuyuki Aihara, & Tetsuya J. Kobayashi. (2020). Reliable target ligand detection by noise-induced receptor cluster formation, Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, 30 (1), 011104. https://doi.org/10.1063/1.5140714
August, 2019. 第1回データ駆動数理医科学ワークショップにて口頭発表を行いました。
T細胞抗原識別における実験と理論モデルについてのレビュー論文が公開されました。Kajita, et al., PRE (2017) の解説も載っています。Masashi K. KAJITA, (2019). Quantitative biology of ligand discrimination by immune T cells, SEISAN KENKYU, 71(2), 125-132. https://doi.org/10.11188/seisankenkyu.71.125 (Japanese)
2018年度
8 March, 2019. 第4回デザイン生命工学研究会に参加し、口頭発表およびパネルディスカッションを行いました。
1 March, 2019. 新学術領域研究「細胞ダイバース」第二回若手ワークショップ に参加し口頭発表を行いました。
26 April, 2018. 北大MMCセミナーに参加し口頭発表を行いました。