El Departamento de Arqueología investiga y resguarda colecciones de materiales provenientes de sitios arqueológicos localizados en Rosario y en su región. Desde 1982 se han prospectado distintas áreas de la ciudad, y se realizaron diferentes actividades como recolecciones superficiales, pozos de sondeo y/o excavaciones profesionales que originaron las amplias y variadas colecciones que se refieren en este repositorio. Como se señala en el apartado Marco Jurídico, es tanto obligación como prerrogativa de este Departamento la realización de investigaciones arqueológicas dentro del dominio jurisdiccional de la Municipalidad de Rosario; cualquier actividad arqueológica no autorizada por este Departamento constituye un delito.
Mediante convenios interjurisdiccionales se han realizado también investigaciones arqueológicas en otros ámbitos, localizándose sitios a través del territorio. La investigación de las colecciones generadas han permitido expandir el conocimiento de nuestro pasado regional, como lo atestigua la producción científica al respecto.
Antes de las prospecciones iniciadas desde este Departamento en 1982, no había sitios arqueológicos localizados en el área históricamente conocida como "El Pago de los Arroyos" en su sector santafesino. Hoy, hay decenas. La investigación arqueológica seria y constante ciertamente da sus frutos.