Rafael estudió Biología en la FES Iztacala de la UNAM, hizo su maestría y doctorado en el CIBNOR La Paz. Realizó dos estancias posdoctorales: una en la UAM Iztapalapa y otra en la FES Iztacala UNAM. Actualmente es investigador del departamento de Ecología Marina en CICESE desde enero del 2018.

Es miembro del SNI desde el 2017. Tiene 40 publicaciones en revistas indexadas y tres capítulos de libro. Su obra tiene 470 citas y ha dirigido 18 tesis de posgrado y dos de licenciatura.

Es miembro de la Sociedad Mexicana de Arrecifes Coralinos desde el 2009, de la cuál fue presidente del 2022 al 2024. 

Ha participado en diversos proyectos de investigación enfocados al estudio de los arrecifes de coral en el Pacífico mexicano, así como su respuesta ante el cambio climático.

Ha enfocado su carrera en el estudio de la ecología de corales arrecifales, en especial:

• Estudio de la esclerocronología, crecimiento, calcificación y producción de CaCO3 de corales.

• Reproducción y reclutamiento coralino.

• Ecología funcional de corales arrecifales como base para evaluar

• Vulnerabilidad, variabilidad y resiliencia de ecosistemas arrecifales a la contaminación y cambio climático.

En este evento, estudiantes y egresados de programas de posgrado de instituciones públicas mexicanas comparten sus trabajos de investigación enfocados en la biología y ecología de ecosistemas arrecifales.