황소현

황소현 교수

주요 경력 | 분당차병원 병리과 부교수

생명정보학 전공

학위 | KAIST 박사

Email | blissfulwin@cha.ac.kr

연구 기술 분야 | 생명정보학, 인공지능, 질환타겟 발굴

세부 분야 | 암유전체학, 부인암, 세포노화

핵심어 | 세포노화, 오믹스, 빅데이터, NGS, 암유전체

주요 연구분야


1. 임상 유전체 / 암 유전체

NGS 시퀀싱을 통해 생산되는 환자들의 오믹스 데이터들을 생산하고 분석하여 질환의 원인변이를 찾는 연구를 수행합니다. High-grade Serous Carcinoma (Ovarian cancer)와 Triple negative breast cancer, 그리고 Glioblastoma와 같은 난치성 암과 부인암 환자들의 면역치료방법들을 연구합니다.

2. 시스템 생물학 방법에 기반한 세포노화 연구

암을 조절하는 생물학 메커니즘 중에는 세포의 죽음을 조절하는 방법들이 중요하게 대두되어서 많은 연구가 진 행되고 있습니다. 가장 잘 알려진 Apoptosis 뿐만 아니라 Necroptosis, Pyroptosis 그리고 Ferroptosis 까지 많은 방법들이 밝혀졌는데, 세포의 노화 (Cellular senescence) 과정도 암의 발생과 진행 그리고 전이 과정에 매우 밀 접핚 과정으로 암의 치료법을 발굴하는 데 중요핚 역핛을 하고 있습니다. 노화의 과정을 밝히기 위해서 Functional network와 같은 omics 데이터를 통합 분석하여 문제를 해결하는 연구를 수행합니다.

3. 인공지능 연구 (통계학습, 기계학습과 딥러닝)

임상적 데이터, genomics 데이터 그리고 Systems biology 데이터는 단순핚 통계 분석만으로 데이터를 이해하고 분석하기 어렵기 때문에, 기계학습 방법, 데이터 마이닝과 같은 방법을 통해 생물학 데이터를 이해하고 분석하여, 질환이나 생물학적 문제를 해결하는 연구를 하고 있습니다

주요 연구결과

  1. 바이오마커 발굴과 예측모델 구축

2. 난소암에서 오믹스 연구 및 분석파이프라인 구축

3. 시스템 생물학 기반 질병연구와 세포노화 연구

4. 항암제 내성 극복 및 약물 반응 평가 연구

주요 발표논문


  • USP19 and RPL23 as candidate prognostic markers for advanced-stage high grades serous ovarian carcinoma. Cancers, 13, 3976, 2021. (IF: 6.162)

  • Immune gene signatures for predicting durable clinical benefit of anti-PD-1 immunotherapy in patients with non-small cell lung cancer, Scientific Reports, 10, 643, 2020. (IF:4.379)

  • Clinical impact of somatic variants in homologous recombination repair-related genes in ovarian high-grade serous carcinoma. Cancer Res. Treat., 52, 2, 634-644, 2020. (IF:4.40)

  • HumanNet v2: human gene networks for disease research. Nucleic Acids Res., 8, 47, D573-D580, 2019. (IF:16.971)

  • An integrated systems biology approach identifies positive cofactor 4 as a pluripotency regulatory factor. Nucleic Acids Res. 44 (3): 1203-1215, 2016. (IF:16.971)

  • Systematic comparison of variant calling methods using gold standard personal exome variants. Scientific Reports, 5: 17875, 2015. (IF:4.379)

주요 수행중인 국책과제


  • 효능증대 융합형 면역세포치료 플랫폼 개발

  • BINT 융합 기반 미래세대 세포 및 유전자 치료기술 개발