Система управління закладами освіти визначається законом та установчими документами.
Управління закладом освіти в межах повноважень, визначених законами та установчими документами цього закладу, здійснюють:
- засновник Краснопільська селищна рада;
- директор ліцею Бондар Олександра Григорівна;
- відділ освіти Краснопільської селищної ради;
- колегіальним органом управління закладу освіти є педагогічна рада;
- рада ліцею;
- ПК;
- батьківський комітет.