La T.W. clásica inunda la imagen gradiente a partir de sus mínimos regionales. En imágenes no homogéneas y/o embebidas en ruido no existe un mínimo regional para cada objeto de interés. Esto hace que en estos casos se produzca una sobresegmentación; es decir, cada uno de los objetos está delimitado por más de una región resultado de la T.W.. Para evitar la sobresegmentación se recurre a la definición de marcadores unívocos para cada uno de los objetos de interés. Estos marcadores o semillas inician los algoritmos de inundación indicando los sectores que darán lugar a las “basins “. En consecuencia el éxito de la T.W. depende principalmente de las características de los marcadores.