Un microorganismo o microbio es un organismo de tamaño muy pequeño, que solo se puede apreciar con la ayuda de un microscopio. Se trata de un grupo heterogéneo de organismos (bacterias, hongos, virus, algas unicelulares) con una organización biológica muy elemental. Mayoritariamente son unicelulares, aunque también pueden ser pluricelulares. No todos los microorganismos o microbios causan enfermedades, solo los que son agentes patógenos. De hecho, la mayor parte no son perjudiciales y son vitales para el planeta. Contribuyendo al ciclo de la materia y al equilibrio de la biosfera. Algunos absorben dióxido de carbono y emiten oxígeno (como las algas), otros descomponen materia orgánica.
El microscopio es una herramienta indispensable para visualizar microorganismos debido a su tamaño extremadamente pequeño, que los hace invisibles a simple vista. Gracias a este instrumento, los científicos pueden estudiar en detalle estructuras, funciones y comportamientos de bacterias, protozoos, hongos microscópicos y otros microbios.