O jogo AliCharlie é estruturado em um livro com três capítulos (um para cada tipo de alimento). As histórias dos capítulos têm uma temática narrativa, que é contada por um personagem nomeado Charlie. Os desafios possuem formatos diversificados, como por exemplo, montar um quebra-cabeça, encaixar corretamente partes de uma figura geométrica, dentre outros. Além disso, os desafios propostos são acumulativos estimulando o aluno a fixar o conteúdo apresentado no jogo. As atividades do jogo envolvem o uso dos periférios de entrada  (mouse e teclado), assim o jogador pode melhorar sua habilidade na coordenação motora.