Oral Microbiome-Cancer Interactions

Multi-Omics Dissection of Oral Microbiome-Cancer Interactions Across Human Cancers

Lead by Dr. Hyeun Jeong Song

Our research explores how oral-associated microbial taxa interact with cancer biology across multiple cancer types, including oral, gastric, esophageal, colorectal, and lung cancers. Using patient-derived oral samples, animal models, and public cancer datasets, we integrate microbiome profiling, transcriptomic analysis, and single-cell and spatial host–microbiome analyses to identify disease-associated microbial signatures and accompanying host responses.

We further examine associations between candidate taxa, tumor phenotypes, and clinical outcomes, and validate their context-specific functional effects in cell and animal models, including transcriptional reprogramming, epigenetic regulation, and changes in cancer-cell phenotypes. Ultimately, we aim to connect microbial signatures with cancer biology and clinical characteristics, thereby advancing precision diagnostic biomarkers, risk stratification, and therapeutic target discovery.

우리 연구팀은 구강 연관 미생물 taxa가 구강암뿐 아니라 위암, 식도암, 대장암 및 폐암 등 다양한 암종의 생물학과 어떠한 상호작용을 하는지 연구하고 있습니다. 환자 유래 시료, 동물모델 및 public cancer databases를 바탕으로 microbiome profiling, transcriptome 분석, single-cell 및 spatial host–microbiome 분석을 통합하여 질환 연관 미생물 signature와 이에 수반되는 host response를 규명합니다.

또한 후보 균주와 종양 phenotype 및 임상 outcome 간의 연관성을 분석하고, 세포 및 동물모델에서 transcriptional reprogramming, epigenetic regulation, 암세포 phenotype 변화 등 암종 및 균주별 맥락에서의 기능적 효과를 검증합니다. 이를 통해 미생물 signature를 암 생물학 및 임상 특성과 연결하고, 정밀 진단 바이오마커, 위험도 층화 및 치료 표적 발굴로 확장하는 것을 목표로 합니다.