Warna lambang HMJ-Kimia ada tiga yaitu:
Warna putih, menandakan kesucian dan steril yang menjadi harapan mahasiswa kimia dalam melaksanakan segala aktivitas dalam kehidupan bermasyarakat.
Warna biru, menandakan laut juga menjadi pusat kajian ilmu kimia dan proses pembelajaran ilmunya yang seluas samudera dan sedalam lautan.
Warna hitam, menandakan netral, kuat, tegas dalam pengembangan ilmu pengetahuan dan teknologi (IPTEK).
Warna logo HMJ-Kimia yaitu sebagai berikut:
Bentuk luar segi lima, menandakan 5 rukun Islam dan 5 dasar negara yaitu pancasila yang ada di Negara Kesatuan Republik Indonesia yang menjadi panutan mahasiswa kimia dalam menjalani kehidupan sehari-hari.
Erlenmeyer, menandakan wadah bagi mahasiswa kimia dalam mengekspresikan bakat dan minatnya dalam menjalani proses.Â
Atom yang melingkar, memiliki makna mahasiswa kimia harus dinamis sesua dengan perkembangan zaman yang ada.
Benzena, memiliki ikatan yang kuat yang menjadi dasar bagi persaudaraan yang kuat untuk mahasiswa kimia.
Tulisan, menandakan identitas HMJ-Kimia FST UIN Alauddin Makassar.