從前，在這星球日漸暖化的時代，海底出現一群前所未見的生物——幽海生物群，不曉得是這些未知生物的影響，或者人類延緩暖化的舉動已然失敗，海平面上升的速度超乎預期，迎來「洪水時代」。
可居住面積急遽縮減，資源也不斷減少，人工島的建造趕不上陸地被吞沒的速度，難民與資源戰爭成為最嚴重的問題。在提倡太空發展的領導人物失勢後，人類全面將目標轉向漂浮的人工島，同時各大國競爭起能適應海洋環境的生化和機械技術，企圖從體外防護、體內改造人類以適應新的世界。
人造島、防護服、建築技術與無人機，海上平台興建，到植入式水肺……初步克服技術後，人們得以開採資源，並將生活圈探向海裡、建造鐵殼組合般的聚落，人類要對抗的除了環境，還加上詭譎的幽海生物，在混亂的時局中攜手並進。
初期，海底聚落的居民多數是探尋與採集深海資源的礦工、獵人、海洋學者，以及支持整個海底社會的技師。海下聚落漸漸擴張，湧入工作人口成為城市，而許多原料運上陸地加工，陸地仍為經濟主體，內陸大致保留著舊時的氛圍，人工島成為高級住宅區。陸上人享有天然的空氣、植被與陽光，與海底人逐漸分割，相互依存卻不平等。由於擔心過度擴張人造島（人造大陸）造成淺海居住區陽光不足，海底社會曾發起限制覆蓋面積的抗議。
另一方面人類也加以從各種生物取得靈感，對幽海生物的尖端研究成為最高機密。領導國排除道德輿論，最終取得了技術結晶——水陸兩棲人種「人魚」，其中，更意外產生能使用「冷焰」的亞種，神奇的冷焰能夠吸引或驅逐幽光生物群，被預期能在各據點起到重要防衛作用。
隨著改造手術日漸普及，更優良的生化機械植入體問世，人魚歷經世代發展更能適應海洋，海底節點的能源供給與通訊穩固……人類文明看似回歸正軌，走向美好，然而先進的科技品仍所費不貲，次等設備與非法藥劑在社會大量流通，改造外科的素質參差不齊，加上人們仰賴的科技被大企業壟斷，海底人與陸上人時有糾紛，為世界蒙上一層晦暗。深海更深處，潛伏的影子也漸漸聚集……
洪前時代
為了面對可見的海平面上升危機，各國加速研發海上、水下維生設備，並建設實驗人工島。
在大洪水發生前數年，各地陸續在海中發現到未曾有紀錄的各種生物，稱為「幽海生物群」
大洪水時代
短短十年內平均氣溫上升逾四度，極地融化的大量海水與各地異常天候導致的連續致災性降雨，使得舊時1/3陸地被水覆沒，湮滅九成以上的居住帶。
提早準備遷移至高地、購置求生筏的人，以及人工島上的居民也沒能全然度過，此末日級洪患以及後續導致的糧食短缺、醫療崩壞、疾病滋生……使得人類大量滅亡。
遁海時代
（早期～中期）
人類開始蓬勃發展水中輔具與生化科技，遁入海中生活。各國秘密進行對幽海生物的細胞研究，取得關鍵突破後，誕生一批自稱實現了自我進化的人類——不藉改造與儀器就可以在海中生存的「人魚」，後續更出現亞種「燈子」。
遁海時代
（後期）
人類海中居處遭異種生物襲擊的頻率大增。卡特與克蕾兒出生的年代，兩人因居住的城市毀滅而開啟旅程，並見證了人類衰退的一段歷史。
前幽海時代
(人類休眠）
社會變為人魚主導，再次遭遇氣候末日之時，人族決定全體啟動休眠，只留下小批人類與人魚進行繁衍、維護。人與幽海生物井水不犯河水。
幽海時代
人族解除冬眠。
類人智慧幽海生物出現……