Struktur fail dan direktori dalam Linux berbentuk hirarki. 

Ia bermula dengan direktori akar (/). 

Direktori ini mempunyai beberapa subdirektori yang mengandungi fail-fail dan juga subdirektori sendiri di mana pada setiap direktori terdapat fail-fail program, fail manual dan sebagainya.

Senarai arahan

cd - bertukar ke direktori lain.

clear - kosongkan skrin terminal.

df - laporkan penggunaan ruang cakera sistem fail.

du - papar saiz direktori.

find - cari fail atau direktori.

ls - papar kandungan direktori.

mkdir - cipta direktori.

more - lihat fail teks atau output beransur-ansur.

pwd - papar direktori semasa.

sudo - laksanakan arahan sebagai pengguna lain.

touch - ubah cap masa (timestamp) fail.

tree - papar kandungan direktori menggunakan format pepohon.

4. Persekitaran Dalam Linux