ตำบลบางขัน เป็นตำบลหนึ่งในสี่ตำบลของอำเภอบางขัน สาเหตุที่ได้ตั้งชื่ออำเภอนี้ว่า “บางขัน” เนื่องจากเป็นตำบลหนึ่งในสี่ตำบลของอำเภอบางขันในการขอจัดตั้งตำบลใน พ.ศ. ๒๔๔๐ หลวงพำนักนิคม (เที่ยง ณ นคร) นายอำเภอทุ่งสงสมัยนั้น ได้พิจารณาเห็นสมควรยกฐานะที่ตั้งอยู่บริเวณห้วยบางขันขึ้นเป็นตำบล เรียกว่า “ตำบลบางขัน” โดยตั้งชื่อจากลักษณะภูมิประเทศตามธรรมชาติในบริเวณนั้น ซึ่งมีลำห้วยสายหนึ่งที่ไหลผ่านหมู่บ้านซึ่งบริเวณปากน้ำ คุ้งน้ำ (ลำห้วย ลำคลอง) ซึ่งเป็นร่องน้ำไหลผ่าน (เป็นบริเวณที่วางกับดักจับปลา) ชาวบ้านเรียกว่า “บาง” (น้ำ) ประวัติหนึ่งกล่าวว่าบริเวณนั้นมีต้นขัน (พืชตระกูลเงาะ เมล็ดนำมาสกัดน้ำมันบำรุงผิวหนัง) ขึ้นอยู่ชุกชุม อีกประวัติหนึ่งก็คือ มีเรื่องเล่าว่าบริเวณนั้นมีผู้มาสร้างถิ่นฐานอาศัยอยู่ชื่อนายชัยขัน ต่อมาจึงเรียกชื่อ “บางขัน” สืบต่อมาจนถึงปัจจุบัน