โรงเรียนได้นำกลยุทธ์ไปใช้ในการขับเคลื่อนการบริหารจัดการสถานศึกษาประกอบด้วย 5 กลยุทธ์
1) จัดระบบบริหารจัดการโรงเรียนร่วมกับภาคีเครือข่ายให้เกิดความคล่องตัว ด้านบุคลากร ด้านงบประมาณให้มีประสิทธิภาพมุ่งเน้นผลสำเร็จของงาน
2) พัฒนาคุณภาพผู้เรียนตามมาตรฐานการศึกษาขั้นพื้นฐานกำหนด
3) ส่งเสริม สนับสนุนให้ครูและบุคลากรทางการศึกษาสามารถจัดการเรียนรู้ได้อย่างมีคุณภาพ
4) สนับสนุนให้ครูใช้สื่อเทคโนโลยี และแหล่งเรียนรู้ในการจัดกิจกรรมการเรียนการสอน
5) ส่งเสริม สนับสนุนภาคีเครือข่ายให้มีส่วนร่วมในการพัฒนา คุณภาพการศึกษา
การบริหารการเปลี่ยนแปลงและนวัตกรรมในสถานศึกษาเพื่อพัฒนาโรงเรียนเพ็ญพิทยาคม ด้วยกระบวนการ PDCA โดยยึดหลัก PHENS MODEL