DNAやRNAといった核酸分子を素材としたナノ構造・ナノマシンの開発研究に取り組んでいます．学生には各自の自由な発想に基づいた構造デザイン，機構デザインに挑戦してもらいます．最終的な設計図は専用のソフトウェアを使って描き起こしますが，まずはスケッチやダンボール工作などでイメージを練ることを推奨しています．

Related Publications

• Deepak Karna, Eriko Mano, Jiahao Ji, Ibuki Kawamata*, Yuki Suzuki*, Hanbin Mao* "Chemo-mechanical forces modulate the topology dynamics of mesoscale DNA assemblies" Nat. Commun. 2023, 14(1), 6459.

• Kotaro Watanabe, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Yuki Suzuki* “Multi-reconfigurable DNA Origami Nanolattice Driven by the Combination of Orthogonal Signals” JACS Au 2023, 3(5), 1435–1442.

• Yuki Suzuki*, Ibuki Kawamata*, Kohei Mizuno, Satoshi Murata. “Large deformation of a DNA origami nanoarm induced by the cumulative actuation of tension-adjustable modules”. Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59(14), 6230–6234.

　階層的な自己組織化による「ものづくり」や「パターン形成」に関する研究です．具体的には，上記（I）で作製したナノ構造をビルディングブロックに見立て，自在に組み合わせることで，より複雑で多機能なアーキテクチャを創出することを目指しています．ナノスケールの人工物が多数集まることによって生まれる現象や性質を発見・解明するとともに，それらを制御するための方法論を探求しています．

Related Publications

• Yuki Suzuki*, Hiroshi Sugiyama*, Masayuki Endo*. “Complexing DNA origami frameworks through sequential self-assembly based on directed docking”. Angew. Chem. Int. Ed. 2018, 57(24), 7061–7065.

• Yuki Suzuki, Masayuki Endo and Hiroshi Sugiyama. “Lipid-bilayer-assisted two-dimensional self-assembly of DNA origami nanostructures”. Nat. Commun. 2015, 6, 8052. 

　上記の(I),  (II)で開発したナノ構造やナノデバイスをツールとして，生物学的・生物物理学的問いに挑んでいます．主に，タンパク質分子の集積化効果や近接化効果を調査/制御する目的でDNAナノテノロジーを利用しています．

Related Publications

• Tomoki Kita, Ryota Sugie, Yuki Suzuki*, Shinsuke Niwa* "Modular photostable fluorescent DNA blocks dissect the effects of pathogenic mutant kinesin on collective transport". Cell Rep. Phys. Sci. 2025, 6(2), 102440.

• Hiroki Oda, Shigetaka Nishiguchi, Kazuyoshi Murata, Takayuki Uchihashi, Yuki Suzuki 

“Nanoscale visualization of Drosophila E-cadherin ectodomain fragments and their interactions using DNA origami nanoblocks”

J. Mol. Biol. 2025, 437(2), 168875.