為評估本校整體內部控制制度設計及執行之有效性，故將內部控制之組成五項要素納入機關整體層級自行評估表中，其中「控制作業」一項，並納入作業層級自行評估表中進行評估，以利檢視實際作業是否依程序執行及有無疏漏重要環節。每年至少自行評估一次，遇有特殊情形，得隨時辦理。如業務性質有按月或按季辦理之需要者，各單位得自行訂定評估次數。
考量本校業務屬性單純且規模較小，簡化由各處室辦理整體層級自行評估作業，針對各判斷項目(評估重點)，得依實際業務性質或管理範圍，依整體層級自行評估表(表五)提出評估結果。(參考各機關內部控制制度自行評估原則第三點)
本校自行評估之表件格式如下所列：
表一：各項控制作業自行評估表
表二：作業層級自行評估表
表三：作業層級自行評估統計表
表四：部分落實/未落實項目一覽表
表五：整體層級自行評估表