Được thành lập năm 2007 và trải qua nhiều giai đoạn nâng cấp, hiện đại hóa, hiện nay hệ thống PTN tại BM.CNHH bao gồm 6 PTN chuyên ngành chia làm 2 nhóm chính:

1.  Nhóm  nghiên cứu Hóa sinh Nông nghiệp (Agro-Biochemical Research Group)

• PTN Hóa học Nông nghiệp (Agro- Chemistry Lab)

• PTN Kỹ thuật chuyển đổi sinh khối (Bioconversion Technology Lab)

• PTN Hóa học môi trường (Enviromental Chemistry Lab)

2. Nhóm nghiên cứu Công nghệ hóa học và vật liệu   (Chemical Engineering and Material Science)

• PTN Hóa keo ứng dụng (Colloidal Chemistry Lab)

• PTN Nhiên liệu sinh học và vật liệu tái tạo (Biofuel & Renewable Material Lab)

• PTN Quá trình Thiết bị (Technology halls)

Các PTN  có tổng diện tích khoảng 350 m2 và chủ yếu đặt tại khu nhà Cẩm Tú,  Khoa CNHH&TP.