Existe un estrecho vínculo entre la religiosidad aymara y la medicina tradicional. Esto, ligado a la naturaleza ya las invocaciones divinas, es practicado por los yatiris (sabios).

Tradicionalmente el pueblo Kallawaya, que habita la cordillera Charazani en Bolivia, es a quien pertenecen los yatiris más famosos.

Inmediatamente después de la colonización, las autoridades religiosas y políticas españolas obligaron a los aymaras a convertirse y destruyeron iconos, templos y chullpas.

Una parte no minoritaria de la Iglesia Católica asintió de este comportamiento al punto que jesuitas y franciscanos evangelizaron a los aymaras sin obligarlos a repudiar su religión tradicional y en ocasiones cristianizando a las divinidades tradicionales.

Por ejemplo Thumpa fue transformado en Apu Qullana Awki (creador del mundo) y venerado como Dios, por el cristianismo, y la Pachamama fue venerada como la Virgen María.

Desde el nacimiento de las repúblicas andinas hasta mediados del siglo XX, el sincretismo religioso se practicaba en la clandestinidad.

Hoy en día es común que se ofrezca ch'alla la Pachamama durante las fiestas católicas.

Las iglesias protestantes, en cambio, no ven con buenos ojos el sincretismo religioso y, por ello, han prohibido a los creyentes recurrir a la medicina tradicional.

Un aspecto interesante de esta mezcla entre religiosidad tradicional y cristiana radica en que los campesinos aymaras no le dan mucha importancia a la Navidad, quienes viven mucho más intensamente el carnaval, un período de florecimiento.

En las ciudades, la situación cambia a medida que se sienten menos las tradiciones agrícolas.