於每年六月左右開放三年級學生報名參加，報名成功者會收到科學社筆試通知。

錄取採計成績有分在校成績與筆試成績兩種。在校成績為三年級數學與自然成績，比重各佔20%，筆試成績佔60%，內容為三年級課程內容、自然課外內容、解決問題與邏輯推理。

依照總分高低錄取約15人，其中若是國語平均成績未達80分則不予錄取。錄取名單會在暑假前通知各班導師。

四年級課程為一週一次的課程，會訂在週一至週四的某一天午休，由全體自然老師安排課程內容。

授課教師會在期初社員大會發下行事曆(如圖)，屆時學生可依行事曆的時間前來上課。

高年級課一學年有四次活動，一次為科學相關講座，會外聘講師進行，另外三次為小組競賽活動。其餘為指派性任務，像是永續校園、小鐵人競賽、科展或是其他不定期活動。