Beberapa permasalahan yang ada di program studi tadris IPS adalah sebagai berikut:
a) Program Studi Tadris IPS
1) Program studi tadris IPS belum mendapatkan akreditasi A
2) Jurnal program studi tadris IPS belum terakreditasi
b) Sarana dan prasarana
1) Beberapa sarana dan prasarana yang menunjang keberlangsungan PBM, seperti: AC belum terpenuhi untuk di ruang kelas.
2) Rasio jumlah peralatan dan mahasiswa masih belum memadai
c) Finansial
1) Keterbatasan dana yang dialami FTK UIN Mataram juga berimbas ke program studi tadris IPS
2) Kerjasama pendanaan dengan dunia usaha dan industry (DUDI), dan pemerintah daerah belum bisa dilaksanakan secara maksimal
3) Terbatasnya kemampuan penggalian dana dari masyarakat sebagai sumber dana alternatif
d) Sumber daya manusia
1) Dosen yang berkualifikasi guru besar masih terbatas
2) Belum maksimalnya publikasi ilmiah secara online yang dilakukan oleh dosen
e) Sistem Informasi
1) Pemanfaatan jaringan untuk akademik/pembelajaran belum berkembang secara maksimal
2) Dukungan software yang lengkap dan mudah masih terbatas.
3) Belum memadainya teknisi khusus dalam mengatasi masalah terkait kendala sistem informasi, baik hardware maupun software.