Desde 1917 tres años después de la apertura del Canal de Panamá, se discutió la posibilidad de construir una zona franca en el área en Colón La Cámara de Comercio de Colón planteó el proyecto de una zona franca en 1929 el proyecto fue tomado en cuenta después de la Segunda Guerra Mundial, en 1948.

En 1945 el entonces presidente de la República Enrique Jiménez tuvo la iniciativa de construir la Zona Libre de Colón, aprovechando nuestra posición geográfica de los puertos y la vía fluvial interoceánica, paso crucial de la navegación mundial.

A partir de sus recomendaciones y proyecciones, el gobierno dio su aprobación dos 2 años después Fue hasta junio de 1948 donde se crea el Decreto Ley No 18 de 17 de junio de 1948 como institución autónoma del Estado panameño, como un área para explotar las ventajas competitivas del país al encontrarse en la entrada del Canal de Panamá por el Océano Atlántico.