NTUBSE - 關於研究室主持人

主持人

蕭友晉 (Shiau, Yo-Jin) 副教授

　　蕭友晉博士大學與碩士畢業於國立台灣大學生物環境系統工程學系，碩士班加入張文亮教授指導的研究團隊，碩士論文期間主要研究的題目著重於各種生態工法的生態系服務，並且利用影像辨識與機器學習對溪流生態系之魚類進行非破壞性的監測技術開發。碩士畢業之後，他獲得教育部留學獎學金，並前往美國北卡羅萊納州立大學－生物與農業工程學系攻讀博士。於博士班期間，他加入Dr. Michael Burchell的研究團隊，並主要負責執行美國地質調查所－國家濕地中心(USGS-National Wetland Research Center)於美國東岸的海岸濕地溫室氣體排放與碳匯監測計畫。最後順利於2014年底取得北卡州大生物與農業工程學系博士學位與土壤科學系輔系。

　　蕭博士返國後，進入中央研究院生物多樣性研究中心，加入由邱志郁博士所指導的研究團隊，並擔任博士後研究員的工作。期間繼續針對各種陸域生態系與海岸生態系的元素循環進行多尺度的探討。更於2016年前往中國科學院南京土壤學研究所擔任訪問學者進行交流，學習土壤同位素分子生物學之相關實驗，加強對於土壤生物地質化學各種面向的研究能力。

　　蕭博士目前的研究團隊主要著重在自然界營養物質變化對於生態系統的衝擊等相關研究，尤其著重於結合野外田間採樣與實驗室水質、土壤等物理化學分析的整合。藉由實驗室的小規模試驗結果，與自然界的田間尺度的環境進行比較驗證，探討生態系統從微觀到巨觀的各種變化。未來並希望能整合程式設計等專業，對大區域生態系統進行整體的模擬。

學歷

美國北卡羅來納州立大學生物與農業工程學系博士

土壤科學系輔系

台灣國立臺灣大學生物環境系統工程學系碩士

台灣國立臺灣大學生物環境系統工程學系學士

經歷

國立臺灣大學生物環境系統工程學系副教授 (2024/08 - 迄今 )

國立臺灣大學生物環境系統工程學系助理教授 (2019/08-2024/07 )

國立高雄科技大學環安系助理教授 (2018/02-2019/07)

中央研究院生物多樣性研究中心博士後研究 (2015/06-2018/01)

中國科學院南京土壤研究所訪問學者 (2016/11-2016/12)

環境資源研究發展基金會副研究員 (2015/04-2015/06)

研究興趣

生物地質化學

環境微生物

分子生物學

濕地生態工程

影像辨識監測

期刊論文 (*通訊作者)

Accepted:

Refereed Journal Articles:

2025

Chen, T.-K., & Shiau, Y.* (2025). Seasonal dynamics of 13C-labeled methanotrophic communities in constructed wetlands of different ages in Taiwan. Journal of Environmental Management, 394, Article 127333. (SCI, IF=8.4, Ranking=31/374)

Y. Shiau*, T.-K. Chen, Z. Jia*, C.-W. Lin and C.-Y. Chiu (2025), Methane oxidation potential and niche differentiation of aerobic methanotrophs in coastal mangrove forest soils along a 370 km long coastline in Taiwan, Environmental Science & Technology. (SCI, IF=12.4, Ranking=20/374)

T.-K. Chen and Y. Shiau* (2025), Effects of Soil Properties and Seasonal Variations on Microbial Communities in Constructed Wetlands, Microbial Ecology. (SCI, IF=3.9, Ranking=9/108)

Ke, B.-S., Shiau, Y.-J., Wang, B.-T., Chang, C.-H., Jim Yeh, T.-C., & Tsai, J.-P. *(2025). Time-lapsed hydraulic tomography for monitoring hydraulic conductivity field evolution caused by pore-clogging. Water Resources Research, 61, e2023WR036786 (SCI)

2024

H.-T. Lin, J.-I. Y., Y.-T. Wu, Y. Shiau, L. L., S.-H. Yang* (2024), The spatiotemporal variations of marine nematode populations may serve as indicators of changes in marine ecosystems, Marine Pollution Bulletin, 211, 117373 (SCI)

Nien T., Chan T., Li Y., Liu T., Shiau Y., Ho M.* (2024). Two cyanobacterial species exhibit stress responses when grown together in visible light or far-red light. mSphere 9:e00251-24. (SCI)

Y.-L. Yu, W.-Z. Lin, Y.-J. Shiau, R. Y. Surampalli, C.-M. Kao* (2024), Development of a slow-release CO2 absorbent material for alkaline activation of persulfate oxidation of TCE and CO2 capture. Separation and Purification Technology, 348, 127807 (SCI)

2023

S. Negi, S.-Y. Pan*, and Y. Shiau (2023). Decarbonizing Food Waste Treatment through Anaerobic Codigestion with Yard Waste: Energy, Engineering, Economic, and Environmental Aspects. ACS ES&T Engineering (SCI)

Chang, C.-H., Lin, Y.-F., Shiau, Y.-J., Tsai, Y.-Z. and Tsai, J.-P.* (2023), Effects of Soil Type and Thermal Boundary on Predicting Temperature Profiles and Groundwater Fluxes. Groundwater (SCI)

W.-T. Huang and Y. Shiau* (2023). Potential Changes in Soil Microbial Composition under 1,2-Dichlorobenzene Contamination. Sustainability (SCI, IF=3.89, Ranking=40.6%)

2022

S.-R. Jhang, Y.-Y. Chen, Y. Shiau, C.-W. Lee, W.-N. Chen, C.-C. Chang, C.-F. Chiang, H.-Y. Guo, P.-K. Wang, Charles C.-K. Chou* (2022). Denitrifiers and Nitrous Oxide Emissions from a Subtropical Vegetable Cropland. ACS Earth and Space Chemistry (SCI, IF=3.56, Ranking=39%)

Y.-P. Lin, A. Ansari, T. N.-D. Cao, Y. Shiau, H.-S. Lur, A. Muzaffar, R. F. Wunderlich, H. Mukhtar* (2022). Using inhibitors to trade greenhouse gas emission for ammonia losses in paddy soil: A zero-sum game. Environmental Technology & Innovation. 102547 (SCI, IF=5.26, Ranking=19.2%)

2021

Shiau Y.* and E.-H. Chang* (2021). Microbial Community Development in Tropical Constructed Wetland Soils in Taiwan. Science of the Total Environment 812: 152563 (SCI, IF=7.96, Ranking=9.1%)

Shiau Y.*, Y.-A. Chen, C.-R. You, Y.-C. Lai, M. Lee (2021). Compositions of sequestrated soil carbon in constructed wetlands of Taiwan. Science of the Total Environment 805: 150290 (SCI, IF=7.96, Ranking=9.1%)

Shiau Y., R.S.W. Yam, E.-H. Chang, J.-M. Wu, T.-H. Hsu, and C.-Y. Chiu* (2021). Composition and activity of N2-fixing microorganisms in mangrove forest soils. Forests 12(7): 822 (SCI, IF=2.22, Ranking=25.0%)

2020

Shiau Y., E.-H. Chang, G. Tian, T.-H. Chen and C.-Y. Chiu* (2020). Improvements in soil C and N compositions after 40 and 80 years of reforestation in subtropical low mountain forests. Journal of Geophysical Research-Biogeosciences 125: e2019JG005598 (SCI, IF=3.62, Ranking=20.5%)

Shiau Y., C.-W. Lin, Y. Cai, Z. Jia, Y.-T. Lin and C.-Y. Chiu* (2020). Niche differentiation of active methane-oxidizing bacteria in estuarine mangrove forest soils in Taiwan. Microorganisms 8: 1248 (SCI, IF=4.15, Ranking=27.4%)

Shiau Y. and C.-Y. Chiu* (2020). Biogeochemical Processes of C and N in the Soil of Mangrove Forest Ecosystems. Forests 11(5):492 (SCI, IF=2.12, Ranking=25.4%)

2019

E.-H. Chang, G. Tian, Y. Shiau, T.-H. Chen, C.-Y. Chiu* (2019). Influence of Thorny Bamboo Plantations on Soil Microbial Biomass and Community Structure in Subtropical Badland Soils. Forests 10(10): 854 (SCI, IF=2.12, Ranking=25.4%)

Shiau Y.*, M. R. Burchell, K. Krauss, S. W. Broome and F. Birgand (2019). Carbon sequestration in a recently created brackish marsh in eastern North Carolina, USA. Ecological Engineering 127: 579-588 (SCI, IF=3.02, Ranking=29.7%)

2018

Lin, Y.-T., W. B. Whitman, D. C. Coleman, Y. Shiau, S.-H. Jien, and C. Chiu* (2018). The influences of thorny bamboo growth on the bacterial community in badland soils of southwestern Taiwan. Land Degradation and Development 29(8): 2728-2738 (SCI, IF=9.79, Ranking=1.0%)

Shiau Y., Y. Cai, Z. Jia, C. Chen and C. Chiu* (2018). Phylogenetically distinct methanotrophs modulate methane oxidation in rice paddies across Taiwan. Soil Biology and Biochemistry 124: 59-69 (SCI, IF=4.86, Ranking=5.9%)

Shiau Y., C. Pai; J. Tsai, W. Liu, R. S.W. Yam, S. Chan and C. Chiu* (2018). Characterization of phosphorus in a toposequence of subtropical per-humid forest soil facing a subalpine lake. Forests 9(6): 294 (SCI, IF=1.95, Ranking=20.3%)

Shiau Y., Y. Cai, Y.-T. Lin, Z. Jia and C. Chiu* (2018). Communities structure of active aerobic methanotrophs in red mangrove (Kandelia obovata) soils under different frequency of tides. Microbial Ecology 75: 761-770 (SCI, IF=3.23, Ranking=3.8%)

2017

Shiau Y. and C. Chiu* (2017). Changes in biochemical and chemical properties in a cedar plantation invaded by moso bamboo. Forests 8(7): 222 (SCI, IF=1.95, Ranking=20.3%)

Shiau Y., T. Chung, J. Chen, G. Tian and C. Chiu* (2017). 13C NMR spectroscopy characterization of particle-size fractionated soil organic matter in subalpine forest and grassland ecosystems. Botanical Studies 58: 23. (SCI, IF=1.45, Ranking=45.0%)

Shiau Y., M. Lin, C. Tan, G. Tian and C. Chiu* (2017). Assessing N2 fixation in estuarine mangrove soils. Estuarine, Coastal and Shelf Science 189: 84-89 (SCI, IF=2.34, Ranking=23.1%)

Shiau Y., H. Wang, T. Chen, S. Jien, G. Tian and C. Chiu* (2017). Improvement in the biochemical and chemical properties of badland soils by thorny bamboo. Scientific Reports 7: 40561 (SCI, IF=5.23, Ranking= 11.3%)

Shiau Y., S. Lee, T. Chen, G. Tian and C. Chiu* (2017). Salinity effects on biomass and nitrogen uptake of mangrove (Kandelia candel) seedlings using 15N isotope. Aquatic Botany 137: 50-55 (SCI, IF=1.85, Ranking=34.0%)

2016

Shiau Y.*, M. R. Burchell, B. Broome, K. Krauss, F. Birgand and S. W. Broome (2016). Greenhouse gas emissions from a created brackish marsh in eastern North Carolina. Wetlands 36(6): 1009-1024 (SCI, IF=1.50, Ranking=56.8%)

Shiau Y., V. Dham, G. Tian and C. Chiu* (2016). Factors influencing removal of sewage nitrogen through denitrification in mangrove soils. Wetlands 36(4): 621-630. (SCI, IF=1.50, Ranking=56.8%)

Before 2016

張文亮，蕭友晉*，虞淨卉 (2010)。影像辨識計算金瓜寮溪魚類數目之研究。台灣農業工程學報 56(1): 52-60. (EI)

蕭友晉、張文亮* (2006)。應用圖形辨識於青萍數量之計算。台灣農業工程學報53(1): 13-21. (EI)

蕭友晉、張文亮* (2006)。應用混合高斯理論於翡翠水庫集水區溪流魚類數量之計數。工程環境會刊 17: 105-113

研討會報告

T-K Chen, W-T Huang, Y-J Shiau* (2024). Methanogenic and methanotrophic activities along with the related microbial compositions in conetructed wetlands in different ages. the 9th international symposium on the interactions of soil minerals with organic matter and microbes (ISMOM 2024). Tsukuba, Japan. October 16-18.

陳詣璿、蕭友晉 (2024)。利用穩定同位素13C和15N分析酸性廢水污染對溪流食物網的影響。第二十八屆海峽兩岸水利科技交流研討會，大連市，遼寧省，中國，八月26-30日。

Y-J Shiau* (2024). Dynamics of Methanogens and Methanotrophs in Mangrove Forests of Northern Taiwan. 1st International Workshop On Maritime Continent (IWMC2024). Kota Kinabalu, Malaysia, July 29-31.

呂沛儒、蕭友晉* (2024)。稻稈還田與節水技術對水稻田土壤微生物群落結構和溫室氣體排放的影響。2024年土壤肥料研究青年師生成果發表會，台北，台灣，七月15-16日。

陳亭愷*、蕭友晉 (2024)。以次世代定序探討臺灣亞熱帶人工濕地之微生物群落動態。2024年土壤肥料研究青年師生成果發表會，台北，台灣，七月15-16日。

簡睿廷、蕭友晉 (2024)。副熱帶半鹹水人工濕地碳、氮循環之探討。2024年土壤肥料研究青年師生成果發表會，台北，台灣，七月15-16日。

P.-J. Lu, Y.-J. Shiau* (2024). Changes of greenhouse gas emissions and microbial communities in different rice plantations. Japan Geoscience Union (JpGU) Meeting 2024. Chiba, Japan, May 25-31.

J.-T. Chien, Y.-J. Shiau* (2024). Carbon Dynamics and Sequestration Potential in Subtropical Tidal Constructed Wetland. Japan Geoscience Union (JpGU) Meeting 2024. Chiba, Japan, May 25-31.

Y.-J. Shiau*, Y.-W. Zeng, J-t Chen, P-j Lu, Y-S Chen, Y-P Huang, P-C Tseng (2024). Methane fluxes, methanogenic, and methanotrophic activities, and microbial compositions in mangrove forests of Taiwan. Japan Geoscience Union (JpGU) Meeting 2024. Chiba, Japan, May 25-31.

Y-H ZHANG, Y-J SHIAU*, C C.-K. CHOU, S-R JHANG, C-W LEE, Y-Y CHEN, C-C CHANG, W-N CHEN, C-F CHIANG, H-Y GUO (2023). Activity and Compositions of nitrifying microbial community in rice paddy and dry field in Taiwan. The 2023 Conference of International Society of Paddy and Water Environment Engineering, Busan, South Korea. October 23-25.

曾雅微、蕭友晉(2023)。海岸紅樹林濕地活性產甲烷菌族群與其生態區位之研究。第十四屆台灣濕地生態系研討會，台南，台灣，九月一日。

黃玟婷、蕭友晉(2023)。人工濕地活性產甲烷菌族群生態區位之研究。第十四屆台灣濕地生態系研討會，台南，台灣，九月一日。

陳亭愷、蕭友晉(2023)。臺灣亞熱帶人工濕地活性好氧甲烷氧化之生態區位。第十四屆台灣濕地生態系研討會，台南，台灣，九月一日。

Wen-Ting HUANG, Yo-Jin SHIAU (2023). The Activity and Population Structure of Methanogens in Anaerobic Soil of Constructed Wetland by DNA Stable Isotope Probing. The 20th Annual Meeting of the Asia Oceania Geosciences Society (AOGS2023). July 30 - August 4.

Ting-Kai CHEN, Yo-Jin SHIAU (2023). DNA Stable Isotope Probing reveals temporal and spatial variations of active methanotrophs in subtropical constructed wetlands in Taiwan. The 20th Annual Meeting of the Asia Oceania Geosciences Society (AOGS2023). July 30 - August 4.

曾雅微、蕭友晉(2023)。利用穩定同位素探測揭示北台灣紅樹林土壤產甲烷菌群落結構。2023年土壤肥料研究成果青年師生交流會，台中，台灣，七月六日。

黃玟婷、蕭友晉(2023)。利用DNA穩定同位素技術探討人工濕地產甲烷菌群族群與活性。2023年土壤肥料研究成果青年師生交流會，台中，台灣，七月六日。

陳亭愷、蕭友晉(2023)。以DNA穩定同位素探針技術探討臺灣亞熱帶人工濕地活性好氧甲烷氧化菌之結構。2023年土壤肥料研究成果青年師生交流會，台中，台灣，七月六日。

張雅涵、蕭友晉(2023)。台灣農田土壤硝化活性微生物族群結構分布與其環境因子之相關性。2023年土壤肥料研究成果青年師生交流會，台中，台灣，七月六日。

Y-C Hsu, C-Y Chiu, Y-H Huang, P-Y Yu and Y-J Shiau* (2023). Compositions of soil blue carbon in mangrove forests in Taiwan. The 12th International Conference on Earth Observations & Societal Impacts, Taipei, Taiwan. June 12-13

何勝惟、詹明修、潘聖文、黃薏瑄、蕭友晉(2022)。陽明山溫泉酸排廢水對南磺溪水質與溪流生態之影響。農業工程研討會，十二月二日。

黃玟婷、蕭友晉(2022)。1,2-二氯苯污染環境下土壤微生物組成結構之潛在變化。農業工程研討會，十二月二日。

黃玟婷、蕭友晉(2022)。人工濕地厭氧土壤之嗜甲烷菌活性與族群結構之研究。農業工程研討會，十二月二日。

張雅涵、蕭友晉(2022)。亞熱帶地區人工濕地的土壤性質變化。農業工程研討會，十二月二日。

陳亭愷、蕭友晉(2022)。不同年份及季節人工濕地土壤好氧甲烷氧化菌之研究。農業工程研討會，十二月二日。

曾雅微、蕭友晉(2022)。北台灣紅樹林土壤產甲烷古菌活性與族群結構。農業工程研討會，十二月二日。

簡睿廷、張書民、黃其軒、呂沛儒、蕭友晉 (2021)。人工濕地土壤性質隨年份之變化。農業工程研討會。October 22

呂沛儒、簡睿廷、蕭友晉 (2021)。應用厭氧發酵法降解屠宰場廢血污水之可行性研究。農業工程研討會。October 22

呂沛儒、陳亭愷、蕭友晉 (2021)。不同完工年份下的人工濕地土壤二氧化碳與甲烷排放潛勢變化。農業工程研討會。 October 22

黃其軒、蕭友晉、黃玟婷、簡睿廷 (2021)。不同有機質對厭氧微生物處理酸性硫酸鹽污水影響。水利工程研討會。September 10

呂沛儒、蕭友晉、黃其軒、張書民 (2021)，藻類去除廢豬血中汙染及其應用。水利工程研討會。September 10

Shiau Y., Y.-A. Chen, C.-R. You, Y.-H. Huang (2021)，Changes of Microbial Community Soil Carbon in Constructed Wetlands. The 10th International Conference on Earth Observations & Societal Impacts, Taoyuan, Taiwan. August 23-24.

黃薏瑄、尤崇任、陳畇安、蕭友晉 (2021)。台灣污水型人工濕地中土壤碳組成。第十二屆台灣濕地生態系研討會，台北，台灣。May 2.

陳畇安、蕭友晉 (2021)。污水型人工濕地中微生物族群的消長。第十二屆台灣濕地生態系研討會，台北，台灣。May 2.

蕭友晉(2019)。海岸紅樹林土壤微生物之碳氮生地化反應。2019 土壤微生物生態學在農業和森林研究的展望研討會，台北，台灣。November 25.

Shiau Y. (2019). Biological N2 fixation of mangrove forest soils in the western coastal of Taiwan. The Fourth Asian Marine Biology Symposium, Taipei, Taiwan. November 4-6.

林巧雯、蕭友晉、邱志郁(2019)。台灣海岸紅樹林土壤生物固氮作用潛能。2019兩岸濕地聯合研討會。高雄，台灣。May 4-5.

黃玟婷、蕭友晉(2019)。環境變遷下人工濕地土壤微生物群落研究。2019環境安全衛生暨消防工程研討會，高雄，台灣。April 21.

尤崇任、蕭友晉(2019)。人工濕地藍碳儲存的生態系服務效益。2019環境安全衛生暨消防工程研討會，高雄，台灣。April 21.

陳奕伸、蕭友晉、邱志郁(2018)。添加葡萄糖與生物探對惡地土壤微生物呼吸速率之影響。106年森林資源永續發展研討會，宜蘭，台灣。October 25-26.

M. R. Burchell, R. Etheridge, Y. Shiau, F. Birgand and K. Krauss (2017). Potential for created brackish marshes to provide water quality and carbon sequestration ecosystem services. WETPOL 2017. Big Sky, MT, USA. August 21-25.

蕭友晉、林明鋒、譚鎮中、田光隆、邱志郁(2019)。紅樹林濕地土壤固氮潛勢。第八屆台灣濕地研討會，南投，台灣。 May 5-6.

Shiau Y., G. Tian, M. Lin, C. Tan and C. Chiu (2016). N2-fixation and denitrification potential in mangrove soils. 2016 International Wetlands Conference in Taiwan. Taipei, Taiwan. September 13-14.

Shiau Y., M. R. Burchell, K. Krauss, S. W. Broome and F. Birgand (2016). Estimation of carbon sequestration and reduction of global warming potential in a created brackish tidal marsh. 2016 International Wetlands Conference in Taiwan. Taipei, Taiwan. September 13-14.

Burchell M. R., Y. Shiau, K. W. Krauss and S. Broome (2014). Carbon Sequestration Potential of a Young Brackish Marsh Restoration Project Located in Eastern NC. Restore America's Estuaries 7th National Summit on Coastal and Estuarine Restoration and 24th Biennial Meeting of the Coastal Society. National Harbor, MD, USA. November 1 – 6.

Shiau Y., M. R. Burchell and S. Broome (2014). Importance of Carbon Sequestration and Greenhouse Gas Emissions in Tidal Marshes, Using a Restored Brackish Marsh in Eastern North Carolina, USA as an Example. ICLEI 2014 LAB Symposium on BiodiverCites without Boundaries. Kaohsiung, Taiwan. June 23 – 25.

Shiau Y., M. R. Burchell and S. Broome (2014). Carbon Sequestration and Soil Carbon Accumulation in a 7-year-old Constructed Brackish Marsh in eastern NC. 14th Annual American Ecological Engineering Society Meeting. Charleston, SC, USA. June 9 – 11.

Shiau Y. and M. R Burchell (2014). Daily Variation of Carbon Dioxide Flux in a Constructed Salt Marsh in eastern NC. 14th Annual American Ecological Engineering Society Meeting. Charleston, SC, USA. June 9 – 11.

Shiau Y., M. R. Burchell and S. Broome (2014). Carbon Sequestration and Greenhouse Gas Emissions in a Restored Brackish Marsh in Eastern NC. WRRI 2014 Annual Conference. Raleigh, NC, USA. March 19 – 20.

演講

台灣水田土壤甲烷氧化微生物族群結構與活性。國立台灣大學植物病理與微生物學系，Dec 10, 2020

人工濕地甲烷排放、氧化與碳儲存。台灣微生物生態學學會與中華民國真菌學會聯合年會暨應用微生物研討會，Oct 18, 2020

氣候變遷與人為汙染下的紅樹林生態。微生物、環境與農業研討會，Jun 23, 2020.

濕地生態系的甲烷氧化。2020 MiTalk 年輕科學家工作坊，Jan 16-17, 2020.

Anaerobic ecosystems under climate change impacts。國立成功大學，Nov 20, 2019.

計畫

執行中：

人工濕地土壤溫室氣體反應之活性微生物族群結構之研究－計畫主持人 (2021/08-2024/07) (110-2313-B-002 -033 -MY3) (國科會)

紅樹林碳匯機制與碳抵減交易經濟效益評估--紅樹林碳收支與微生物幫浦運作機制 - 計畫主持人 (2023/08-2024/07)(112-2621-M-002 -012) (國科會)

112-113 年建立自然碳匯量化報告及查驗機制專案工作計畫 - 協同主持人 (2023/03-2024/11) (行政院環境保護署)

北投溫泉區水資源之水文水理水質及生態監測整合研究計畫 - 計畫主持人 (2023/04-2024/04) (農田水利署)

已結案：

國科會

以生物地質化學和土壤微生物學的觀點，解析氣候變遷下海岸濕地的生態服務功能--河口生態系大氣反應性氮化物排放與土壤微生物族群結構－計畫主持人 (2019/08-2020/09) (108-2621-M-002-027) (科技部)

以生物地質化學和土壤微生物學的觀點，解析氣候變遷下海岸濕地的生態服務功能--臺灣沿海濕地土壤細菌結構、嗜甲烷菌的地理分布及其環境適應機制－共同主持人 (2019/08-2020/10) (108-2621-M-001-002-) (科技部)

人工濕地甲烷氧化活性與微生物族群結構之研究－計畫主持人 (2018/09-2020/10) (107-2313-B-002-057-MY2) (科技部)

人工濕地活性好氧與厭氧甲烷氧化微生物族群結構之研究－計畫主持人 (2020/08-2021/07) (109-2313-B-002 -031 -) (科技部)

其他機關

鳳山溪布袋蓮防治對策初步探討－計畫主持人 (2018/05-2018/09) (高雄市政府水利局)

活力水典寶-受汙染河川再生夥伴計畫(I)－協同主持人 (2018/04-2018/12) (教育部)

甲殼素二氧化鈦複合材料開發及其對生態土壤微生物之影響評估(I)，子計畫三：甲殼素二氧化鈦複合材料對於台灣海岸生態土壤微生物之影響評估－子計畫主持人 (2018/09-2018/12) (國立高雄科技大學)

甲殼素二氧化鈦複合材料開發及其對生態土壤微生物之影響評估(II)，子計畫三：甲殼素二氧化鈦複合材料對於台灣海岸生態土壤微生物之影響評估－子計畫主持人 (2019/01-2019/07) (國立高雄科技大學)

活力水典寶-受汙染河川再生夥伴計畫(II)－協同主持人 (2019/01-2019/07) (教育部)

磺溪灌溉水源水環境調查與改善－協同主持人 (2020/01-2020/12) (七星基金會)

110年教學實踐育成計畫－計畫主持人 (2021/03-2021/07) (國立台灣大學)

磺溪生物多樣性調查與評估微生物淨化水質之可行性 - 計畫主持人 (2020/12/-2021/09) (七星基金會)

農業施肥對大氣反應性氮化物收支及空氣品質之影響，子計畫一：施肥土讓對大氣之反應性氮化物通量調查－子計畫共同主持人 (2019/01-2021/12) (中央研究院)

以穩定同位素探針與次世代定序技術解析降解含氯有機物之微生物族群結構與活性－計畫主持人 (2021/03-2022/02) (110GA0008001004) (環保署土基會)

磺港溪流域生態環境評估 - 計畫主持人 (2022/03-2022/12) (七星基金會)

海洋及濕地儲碳監測技術研究 - 子計畫主持人 (2023/01-2023/12) (農業部漁業署)

發展土壤碳匯量測方法及建立本土示範計畫 - 協同主持人 (2023/10-2023/12) (農業部農糧署)

研析紅樹林土壤藍碳組成與甲烷微生物幫浦機制研究 - 計畫主持人 (2022/10-2023/09)(行政院環境保護署溫室氣體減量辦公室)

土壤環境微生物數據分析及系統架設 - 計畫主持人 (2022/11-2023/08) (農委會農業試驗所)

生物炭於再生農法模式之水稻及狼尾草栽培土壤碳儲存研究 - 子計畫主持人 (2022/07-2023/12) (高教深耕－國立台灣大學)

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