中垣健人，藤本悠介：評価関数が常に凸となるデータ駆動型フィードフォワード制御器調整手法とその応用，計測自動制御学会論文集，Vol. 61, No. 8 (in press).
鶴田柊哉，藤本悠介：追従誤差を単調減少させる逆モデル更新型反復学習制御 ，計測自動制御学会論文集，Vol. 61, No. 8 (in press).
吉田侑史，南祐樹，石川将人，藤本悠介：動的量子化器のデータ駆動型設計の実機検証：モデル化困難な要素を有するモータ制御系への適用 ，計測自動制御学会論文集，Vol. 61, No. 8 (in press).
Hiroshi Okajima, Yusuke Fujimoto, Hiroshi Oku, Haruto Kondo: Cyclic Reformulation Based System Identification for Periodically Time-varying Systems, IEEE Access, Vol. 13, pp. 26483--26593, 2025. (open access)
Yusuke Fujimoto, Yuki Okamoto, Ken Takaki: Efficient Implementation of Kernel Regularization based on ADMM and Its Application to Room Impulse Response Estimation, IEEE Access, Vol. 12, pp. 152721--152729, 2024. (open access)
Yusuke Fujimoto: Iterative Learning Control with Inverse Model Updated with Quadratic Optimization, Systems & Control Letters, Vol. 188, 105797, 2024. (open access)
古賀聖人，白石靖幸，藤本悠介：モデル予測制御によるTABSの最適制御手法の提案，日本建築学会環境系論文集，Vol. 89, No. 817, pp. 141--146, 2024.
藤本悠介：ノンパラメトリック区分的アフィンモデルを用いた航空レーザ測量データからの地表面推定とその応用，計測自動制御学会論文集，Vol. 60, No. 4, pp. 337--344, 2024.
Yusuke Fujimoto, Toshiharu Sugie: Joint Input-Output Identification of Unstable Systems with Kernel Regularization, Control Theory and Technology, Vol. 22, No. 5, pp. 195--202, 2024.
小薗貴寛，藤本悠介：入力制約下で最適サーボ系を実現するデータ駆動型フィードフォワード入力設計，計測自動制御学会論文集，Vol. 59, No. 3, pp. 153--161, 2023.
佐藤宏樹，藤本悠介：ベイズ最適化による制御器パラメータ調整のためのカーネル関数，計測自動制御学会論文集，Vol. 58, No. 11, pp. 505--511, 2022.
Yusuke Fujimoto, Hiroki Sato, Masaaki Nagahara: Controller Tuning with Bayesian Optimization and Its Acceleration: Concept and Experimental Validation, Asian Journal of Control, Vol. 25, No. 3, pp. 2408--2414, 2022. (open access )
佐藤宏樹，藤本悠介：DD-CLUTと準最適なVRFTの等価性について，計測自動制御学会論文集，Vol. 58, No. 6, pp. 314--316, 2022.
Yusuke Fujimoto: Estimated Response Iterative Tuning with signal projection, IFAC Journal of Systems and Control, Vol. 19, 100179, 2022 (open access ).
阿蘇大志，藤本悠介：インパルス応答表現を用いたERITの実機検証，計測自動制御学会論文集，Vol. 58, No. 3, pp. 141--148, 2022.
徳重達樹，藤本悠介，永原正章：電動車いすのLPV-FIRモデリングとそのモデル予測制御への応用，計測自動制御学会論文集, Vol. 57, No. 3, pp. 156--161, 2021.
Yusuke Fujimoto: Kernel Regularization in Frequency Domain: Encoding High-Frequency Decay Property, IEEE Control Systems Letters, Vol. 5, No. 1, pp. 367--372, 2020 (Open Access).
Yusuke Fujimoto, Tatsuki Tokushige, Masaaki Nagahara: Bayesian LPV-FIR Identification of Wheelchair Dynamics and Its Application to Feedforward Control, SICE Journal of Control, Measurement, and System Integration, Vol. 13, No. 4, pp. 208--213. 2020.
中野雄一郎，藤本悠介，杉江俊治：ベイズ最適化を用いた制御器チューニング，計測自動制御学会論文集，Vol. 55, No. 4, pp. 269 -- 274, 2019.
Yusuke Fujimoto, Toshiharu Sugie: Kernel-Based Impulse Response Estimation with A Priori Knowledge on the DC Gain, IEEE Control Systems Letters, Vol. 2, No. 4, pp. 713--718, 2018.
Yusuke Fujimoto, Wataru Kasai, Toshiharu Sugie: Informative Input Design for Bayesian Identification of LPV systems, SICE Journal of Control, Measurement, and System Integration, Vol. 11, No. 3, pp. 214--220, 2018.
Yusuke Fujimoto, Ichiro Maruta, Toshiharu Sugie: Input Design for Kernel-Based System Identification from the Viewpoint of Frequency Response, IEEE Transactions on Automatic Control, Vol. 63, No. 10, pp. 3075--3082, 2018.
Yusuke Fujimoto, Toshiharu Sugie: Informative Input Design for Kernel-Based System Identification, Automatica, Vol. 89, pp. 37--43, 2018.
Yusuke Fujimoto, Ichiro Maruta, Toshiharu Sugie: Optimal distance function for locally weighted average prediction of Just-in-Time Methods, Asian Journal of Control Vol. 20, No. 6, pp. 2055-2064, 2017.
藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：ノンパラメトリック表現を用いたデータ駆動制御，計測自動制御学会論文集，vol. 51, No. 12, pp.829-835, 2015.
藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：推定Hessianを利用したノンパラメトリックPWAモデルの構築法，計測自動制御学会論文集，vol. 51, No. 3, pp.197-205, 2015.
藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：ノンパラメトリック区分的アフィンモデルのl1最適化に基づく単純化，システム制御情報学会論文誌，vol. 27, No. 4, pp. 141-148, 2014
R. Miyoshi, Y. Fujimoto: Adaptive Controller Tuning by Factorized VRFT and Recursive Least-Squares, SICE International Symposium on Control Systems (ISCS) 2025, Osaka, March 2--5, 1A1-2, 2025.
Y. Fujimoto, Y. Minami: Design of dynamic quantizer directly from input-output data, SICE Annual Conference 2024 (SICE FES 2024), Kochi, August 27-30, pp. 258--262, 2024.
Y. Fujimoto: Categorization of Data-driven Feedback Tuning Methods: Forward, Inverse, and Factorization approaches, 22nd IFAC World Congress (IFAC 2023), Yokohama, July 9-14, pp. 10890--10894, 2023.
Y. Fujimoto: Kernel Regularization for Unstable Systems, 61st IEEE Conference Decision and Control (CDC 2022), Cancun, December 6-9, pp. 209--214, 2022.
M. Nagahara, Y. Fujimoto, Y. Yamamoto: Sparse system identification with kernel regularization, 25th International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems (MTNS2022), Sep. 12-16, 2022.
Y. Fujimoto, T. Sugie: Joint Input-Output Identification of Unstable Systems with Kernel Regularization, SICE Annual Conference 2022, September 6-9, Kumamoto, pp. 679--681, 2022.
Y. Fujimoto: Kernel Regularization for Low-Frequency Decay Systems, 60th IEEE Conference Decision and Control (CDC 2021), online, December 13-15, pp. 3014--3019, 2021.
Y. Fujimoto: Iterative Learning Control Not to Interfere with Feedback Control, 3rd IFAC Conference on Modelling, Identification, and Control of Nonlinear Systems (MICNON 2021), online, September 15-17, pp. 486--489, 2021.
Y. Fujimoto, H. Sato: Kernel Function Specialized for Controller Tuning via Bayesian Optimization, SICE Annual Conference 2021, online, September 8-10, pp. 391--393, 2021.
Y. Fujimoto: Efficient Implementation of Kernel Regularization based on ADMM, the 19th IFAC Symposium on System Identification (SYSID 2021), online, July 13-16, pp. 473--477, 2021.
Y. Fujimoto: Kernel Regularization in Frequency Domain: Encoding High-Frequency Decay Property, 59th IEEE Conference on Decision and Control (CDC2020), online (Dec. 2020).
Y. Fujimoto: Time-Frequency Regularization for Impulse Response Estimation, SICE Annual Conference 2020 (online), September 23-26, pp. 1329-1332 (2020).
Y. Fujimoto, H. Sato, M. Nagahara: PID Controller Tuning with Bayesian Optimization and Its Acceleration, SICE Annual Conference 2020 (online), September 23-26, pp. 1341-1342(2020).
Y. Fujimoto, T. Tokushige, M. Nagahara: Bayesian LPV-FIR Identification of Wheelchair Dynamics, SICE Annual Conference 2019, Hiroshima, September 10-13, pp. 1036--1039 (2019. 9. 12).
Y. Fujimoto, F. Abe, M. Nagahara: Room Impulse Response Estimation with Kernel-Based Regularization, SICE Annual Conference 2019, Hiroshima, September 10-13, pp. 528--531 (2019. 9. 11).
Y. Fujimoto, T. Sugie: Kernel-Based Impulse Response Estimation with A Priori Knowledge on the DC Gain, 57th IEEE Conference on Decision and Control (CDC2018), Miami, December 17-19 (2018. 12. 17)
Y. Fujimoto, W. Kasai, T. Sugie: Update of Feedforward Compensation with Experimental Data based on Kernel Regularized Identification, 18th IFAC Symposium on System Identification, Stockholm, July, 9-11, pp. 192--196 (2018. 7. 9).
Y. Fujimoto, T. Sugie：Goal-Oriented Input Design for Kernel-Based System Identification, 56th IEEE Conference on Decision and Control (CDC2017), Melbourne, December 12-15, pp. 3398--3402 (2017.12.13)
Y. Fujimoto, I. Maruta, T. Sugie: On a Relationship between Integral Compensation and Stochastic Gradient Descent, SICE Annual Conference 2017, Kanazawa, September 19-22, pp. 343 (2017.9.19)
Y. Fujimoto, I. Maruta, T. Sugie: Extension of First-Order Stable Spline Kernel, 20th IFAC World Congress (IFAC 2017), Toulouse, July 10-14, pp. 15481--15486 (2017.7.14)
Y. Fujimoto, T. Sugie: Informative Input Design for Kernel-Based System Identification, 55rd IEEE Conference on Decision and Control (CDC2016), Las Vegas, December 12-14, pp. 4636--4639(2016.12.13)
Y. Fujimoto, I. Maruta, T. Sugie: Synthesis of non-parametric type controllers based on I/O data from closed-loop experiment, SICE Annual Conference 2015, Hangzhou, July 28-30, pp.835--840(2015.7.28)
Y. Fujimoto, I. Maruta, T. Sugie: Error Bound Analysis and Optimal Construction of Non-Parametric PWA Models, 53rd IEEE Conference on Decision and Control (CDC2014), Los Angeles, December 15-17, pp. 6528--6535(2014.12.17)
岡島寛，藤本悠介，奥宏史：サイクリングによる周期時変系のシステム同定と諸行列の性質，第12回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2025. 3. 2--5, 3A8-1, 2025.
矢田飛鳥，藤本悠介：積分器を含む制御器のための Factorized VRFT，第12回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2025. 3. 2--5, 2M3-3, 2025.
高嵜大貴，藤本悠介：チャネル間の類似性を活用したステレオデータからのインパルス応答推定，第12回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2025. 3. 2--5, 2A3-5, 2025.
大貝勇登，藤本悠介：Factorized VRFTに用いるプレフィルタに関する検討，第12回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2025. 3. 2--5, 2A3-4, 2025.
鶴田柊哉，藤本悠介：Quadratically-optimal Iterative Inversion Control の追従誤差について，第12回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2025. 3. 2--5, 1PS1-19, 2025.
中垣健人，藤本悠介：二次最適化を利用したデータ駆動型フィードフォワード制御器調整とその応用，第12回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2025. 3. 2--5, 1PS1-9, 2025.
三好龍人，藤本悠介：ドローンを用いたFactorized ERITの実機検証，第68回システム制御情報学会，2024. 5. 24-26, pp. 886--890 (2024. 5. 26).
オウセン，藤本悠介：多出力系の特定出力に着目したERITとその実機検証，第11回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2024. 3. 17-20, 2A3-3 (2024. 3. 19).
岡島寛，藤本悠介，奥宏史：離散時間周期時変系に対するシステム同定法の提案，第11回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2024. 3. 17-20, 1M7-4 (2024. 3. 18).
藤本悠介：式誤差モデルの考え方を用いたOne-shot フィードバック制御器調整，第66回自動制御連合講演会，2023. 10. 7--8, pp. 1198--1200 (2023. 10. 8).
藤本悠介：Society 5.0 におけるシステム同定の定式化とその初等的解法について，第66回自動制御連合講演会，2023. 10. 7--8, pp. 561--564 (2023. 10. 7).
中垣健人，藤本悠介：安定余裕を考慮したベイズ最適化による制御器パラメータ調整，第67回システム制御情報学会研究発表講演会，2023. 5. 17-19, pp. 219--224 (2023. 5. 17).
鶴田柊哉，藤本悠介：プラント逆モデルを用いる反復学習制御の実機検証，第41回計測自動制御学会九州支部学術講演会，2022. 12. 3-4, pp. 11--12 (2022. 12. 3).
藤本悠介，岡本美柚，高木健：室内インパルス応答推定におけるカーネル正則化の実験検証，第66回システム制御情報学会研究発表講演会，2022. 5. 18-20，pp. 111--116 (2022. 5. 18).
小薗貴寛，藤本悠介：入力制約下で最適サーボ系を実現するデータ駆動型フィードフォワード入力設計，第9回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2022. 3. 7-10, 1E1-1 (2022. 3. 8).
津川幹尚，藤本悠介，大山隆景，足立修一：プリフィルタを含むシステムのノンパラメトリック同定と頭部伝達関数推定への応用，第64回自動制御連合講演会，オンライン，2021. 11. 13-14, pp. 712--715 (2021. 11. 13).
藤本悠介：新しいPlant-Inversion型反復学習制御について，第64回自動制御連合講演会，オンライン，2021. 11. 13-14, pp. 229--231 (2021. 11. 13).
阿蘇大志，藤本悠介：インパルス応答表現を用いたERITの実機検証，第8回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウム，2021. 3. 1-4，2E2-1（2021. 3. 3）．
津川幹尚，藤本悠介，足立修一：TCカーネルを用いた頭部インパルス応答の推定，第63回自動制御連合講演会，オンライン，2020. 11. 21-22，2B2-1 (2020. 11. 22).
藤本悠介：カーネル正則化を用いたインパルス応答推定の高速な実装について，第63回自動制御連合講演会，オンライン，2020. 11. 21-22，1G3-5 (2020. 11. 21).
吉冨建興，藤本悠介，永原正章：スマートモビリティのための動的経路制御，第62回自動制御連合講演会，札幌，2019. 11. 9 -10, 1A4-04 (2019. 11. 9).
長野陸，藤本悠介，永原正章：空撮を用いたスクミリンゴガイのマッピング技術の検討，第62回自動制御連合講演会，札幌，2019. 11. 9 -10, 1J2-05 (2019. 11. 9).
藤本悠介：信号射影を用いたEstimated Response Iterative Tuning，第62回自動制御連合講演会，札幌，2019. 11. 9 -10, 1H2-02 (2019. 11. 9).
藤本悠介：ベイズ最適化に基づくデータ駆動制御，電気学会制御研究会「データ駆動制御および制御技術一般」，福岡，2019. 6. 29, CT-19-095 (2019. 6. 29).
飯村由信，藤本悠介：入力重みの学習による血糖値のモデル予測制御，2019年電子情報通信学会総合大会，東京，2019. 3. 19-22, A-10-3 (2019. 3. 19)
長野陸，藤本悠介，永原正章：スクミリンゴガイ除去に向けた画像認識技術の検討，第6回制御部門マルチシンポジウム，熊本，2019. 3. 7-9, 3E1-4 (2019. 3. 9)
河西航，藤本悠介，杉江俊治：カーネル正則化法を用いたフィードフォワードチューニングの実験検証，第61回自動制御連合講演会，名古屋，2018. 11. 17-18，10E5 (2018. 11. 18)
藤本悠介：システム同定のためのカーネル選択について，第61回自動制御連合講演会，名古屋，2018. 11. 17-18，1D5 (2018. 11. 18)
徳重達器，藤本悠介，永原正章：画像からのライン方向推定を利用したライントレース，第61回自動制御連合講演会，名古屋，2018. 11. 17-18，8A5 (2018. 11. 17)
河西航，藤本悠介，杉江俊治：カーネル法を用いた二自由度制御器チューニング，第5回制御部門マルチシンポジウム，東京，2018.3.8-11, Su43-3 (2018.3.11)
中野雄一郎，藤本悠介，杉江俊治：ベイズ最適化を用いた制御器パラメータチューニングに関する考察，第5回制御部門マルチシンポジウム，東京，2018.3.8-11, Su43-2 (2018.3.11)
山西利和，藤本悠介，杉江俊治：多チャネル信号の線スペクトル推定とその応用，第5回制御部門マルチシンポジウム，東京，2018.3.8-11, Sa43-2 （2018.3.10）
河西航，藤本悠介，杉江俊治：線形パラメータ変動システムの同定入力に関する考察，第61回システム制御情報学会研究発表講演会，京都，2017.5.23-25, 146-1 (2017.5.23)
藤本悠介，杉江俊治：カーネル型システム同定における周波数重み付入力設計に関する考察，第61回システム制御情報学会研究発表講演会，京都，2017.5.23-25, 146-2 (2017.5.23)
藤本悠介，杉江俊治：カーネル型システム同定のための入力設計に関する一考察，第59回自動制御連合講演会，北九州，2016.11.10-12, pp. 448--449 (2016.11.10)
藤本悠介，杉江俊治：ルベーグサンプル値データを用いたカーネル法に基づくシステム同定，第3回制御部門マルチシンポジウム，名古屋，2016.3.7-10, ポスターセッション (2016.3.7)
藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：Just-in-Time法におけるデータ間距離の最適な尺度に関する一考察，第58回自動制御連合講演会，神戸，2015.11.14-15, 2D1-4 (2015.11.15)
藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：入出力データに基づくノンパラメトリック型制御器の設計，第57回自動制御連合講演会，渋川，2014.11.10-12, pp. 1618-1624 (2014.11.11)
藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：効率的なノンパラメトリックPWAモデルの構築，第1回制御部門マルチシンポジウム，調布，2014.3.4-7, 7D2-3 (2014.3.7)
藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：少数の点からなるノンパラメトリックPWAモデルの構成に関する一考察，平成25年度計測自動制御学会関西支部・システム制御情報学会 若手研究発表会，大阪，pp. 97-100 (2014.1.17)
藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：ノンパラメトリックPWAモデルのl1最適化に基づく圧縮，第57回システム制御情報学会研究発表講演会，神戸，2013.5.15-17, 321-1 (2013.5.17)
藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：PWAモデルのl1最適化に基づく単純化と画像処理への適用，第13回制御部門大会，福岡，2013.3.5-8, P0634 (2013.3.7)
藤本悠介：近似モデルとデータを統合した制御器パラメータ調整―ベイズ最適化によるアプローチ―，計測と制御，Vol. 63, No. 3, pp. 147--152, 2024.
藤本悠介：MATLAB System Identification Toolbox を用いたシステム同定，計測と制御，Vol. 62, No. 9, pp. 551--554, 2023.
藤本悠介：カーネル正則化を用いたインパルス応答推定，システム/制御/情報，Vol. 64, No. 9, pp. 337--342, 2020.
藤本悠介，永原正章：線形システム同定の基礎 -最小二乗推定と正則化の原理，コロナ社，2021．https://www.amazon.co.jp/gp/product/4339014036
特願2023-19551，地表面推定方法、地表面の計測データ処理方法、地表面推定装置、地表面の計測データ処理装置及びプログラム
藤本悠介：ベイズ最適化による制御系のパラメータ調整，日本鉄鋼協会若手フォーラム，9月13日，2023.
藤本悠介：ベイズ最適化による制御系のパラメータ調整，第67回システム制御情報学会研究発表講演会，OS「主観で踏み出すシステム制御：ベイズ推論の工学応用」キーノート講演，5月17日，2023．
藤本悠介：インパルス応答推定のための周波数特性を踏まえた正則化 ，第8回制御工学オンライン研究会，8月31日，2020．
藤本悠介：インパルス応答推定におけるカーネル正則化の基礎，足立研セミナー（WebExによる遠隔配信），4月24日，2020．
藤本悠介：カーネル法による連続時間線形システムの推定，クープマン作用素と機械学習・工学・物理学との接点，九州大学マス・フォア・インダストリ研究所，9月19日，2019．
藤本悠介：ダイナミクスと正則化：カーネルを用いたシステム同定，計測自動制御学会モデルベースト制御における機械学習とダイナミクスの融合調査研究会，慶應義塾大学三田キャンパス，11月26日，2018 ．
Yusuke Fujimoto: Input Design for Kernel-Based System Identification, India-Japan Joint Workshop on Signal Processing, Networks, and Control, Jal Vihar Guest House, IIT Bombay, K V School Road and Lakes Side Road, Powai, Mumbai, September 25, 2018.
藤本悠介：カーネル法に基づくシステム同定のための入力設計，RACOT研究会，アクロス福岡（福岡県福岡市中央区天神1丁目1番1号），2018年6月2日．
2024年度計測自動制御学会論文賞：『入力制約下で最適サーボ系を実現するデータ駆動型フィードフォワード入力設計』に対して
2019年度電気学会 優秀論文発表賞A：電気学会制御研究会「データ駆動制御および制御技術一般」における発表『ベイズ最適化に基づくデータ駆動制御』に対して
計測自動制御学会2016年 制御部門研究奨励賞 ：ポスター発表『ルベーグサンプル値データを用いたカーネル法に基づくシステム同定』に対して（2016.3.8）
計測自動制御学会関西支部 支部長賞（奨励賞）：『推定Hessianを利用したノンパラメトリックPWAモデルの構築法』に対して（2016.1.25）
SICE Annual Conference 2015 Student Travel Grant Award (STGA) （2015.7.30）
2014年度 システム制御情報学会 学会賞（奨励賞） （2014.5）対象発表： 藤本悠介，丸田一郎，杉江俊治：ノンパラメトリック区分的線形モデルのl1 最適化に基づく圧縮，第57回システム制御情報学会研究発表講演会，神戸，2013.5.15-17，321-1（2013.5.17）
2012年度 日本機械学会畠山賞 （2013.3）
第62回自動制御連合講演会 優秀発表賞 ：長野陸，『空撮を用いたスクミリンゴガイのマッピング技術の検討』に対して
科研費基盤研究（B）「躯体蓄熱放射空調を対象としたスパース最適制御の提案・高度化とその社会実装」22H01653，分担総額2000千円（2022. 4 ~ 2025. 3)
科研費若手研究「性能保証と高速学習を両立するデータ駆動制御」22K14281，総額3600千円（2022.4 ~ 2025.3）
公益財団法人北九州産業学術推進機構（FAIS）研究開発プロジェクト支援事業（シーズ創出・実用性検証事業），航空レーザ計測により得られた点群からの不要点自動除去アルゴリズムの開発，総額688千円（2022. 4~ 2023. 3）
JST ACT-X 「数理と情報のフロンティア」領域 「周波数領域の事前知識を用いた動的システム推定」19205777, 総額4500千円（2019. 9~ 2022.3）
同 加速フェーズ総額1500千円（2022.4 ~ 2023.3）
科研費若手研究「超高自由度制御器のデータ駆動設計」19K15017, 総額4160千円（2019. 4~2022. 3）
科研費特別研究員奨励費（DC1）「ノンパラメトリック区分的アフィンモデルを用いたデータ駆動制御法の確立」総額2500千円（2015.4 ~2018.3）