BayesLiNGAMとは？

データから因果グラフを構成する手法"LiNGAM"を実施するための統計ソフトRのパッケージ

インストール

1. R言語をインストール

参考：R言語インストール(2018年 Windows)

2. BayesLiNGAMのパッケージをインストール

参考：構造方程式モデリング「RとBayesLiNGAMによる構造方程式推定」（削除された？）

ダウンロードページの最新バージョン（例 Version 1.1）をクリックし，"bayeslingam.tar.gz"をダウンロードする

3. 以下の手順でRにインストールする

• 1. "bayeslingam.tar.gz"を7-Zipなどを用いて展開

  2. "bayeslingam"を適当なフォルダに置く（例：C:/R/package）．

  3. "bayeslingam/main"にある"loud.R"をテキストエディタで開く

  4. ２行目のcauzality_path<<-"[pass]"の[pass]をbayeslingamのフォルダにする（例：C:/R/package/bayeslingam）

  5. 'bayeslingam/bayeslingam'にある'loadbayeslingam.R'をテキストエディタで開く．

  6. 8-14行目の'trust'のみを消す（例：common_dir<-sprintf("%s/trunk/common",cauzality_path) → common_dir<-sprintf("%s//common",cauzality_path)）

  7. Rで以下のパッケージをインストール：インストールコマンド → install.packages("[package]", dependencies = TRUE)

     1. combinat

     2. fastICA

     3. ggm

     4. mclust

参考：因果分析LiNGAMを試してみた

実行例

以下のページのRプログラム"BayesLiNGAM01.R"および"BayesLiNGAM01-image.R"を使用させていただいた．

参考：構造方程式モデリング「RとBayesLiNGAMによる構造方程式推定」（削除された？）

実行手順

• 1. Rで作業ディレクトリを変更 （例：setwd("C:/R/program/LiNGAM/test/")）

  2. source("BayesLiNGAM01.R") を実行（因果グラフを基にしたデータの作成および因果グラフの復元）

  3. source("BayesLiNGAM01-image.R") （因果グラフの可視化．以下のようなグラフが出力される）