La flora di Massaciuccoli è caratterizzata da una variegatissima gamma di piante acquatiche che, insieme ad altre piante terrestri, trovano in questa area il loro habitat ideale e creano un mosaico vegetale di straordinaria bellezza:

•  Canne: pianta erbacea perenne e dal fusto lungo, cavo e robusto.

•  Giunchi: piante palustri con steli sottili e foglie strette.

•  Salici: alberi con foglie lanceolate, adatti alle zone umide.

•  Ontani: alberi con corteccia grigia e rami pendenti.

•  Tife: pianta erbacea palustre con foglie lunghe e sottili.

•  Iris giallo: pianta perenne con fiori gialli vivaci e foglie strette.

•  Ninfee: piante acquatiche con foglie larghe e fiori vistosi galleggianti.

•  Piante acquatiche come la lenticchia d'acqua e la carolina: specie di piante adattate alla vita in ambienti palustri e lacustri.

La vegetazione è fondamentale per mantenere l'equilibrio dell'ecosistema, offrendo nutrimento e rifugio a numerose specie animali.

La fauna è uno degli aspetti più preziosi dell'Oasi di Massaciuccoli. L'area è riconosciuta come sito di importanza internazionale, soprattutto per l'avifauna, infatti ospita numerose specie di uccelli, sia stanziali che migratori.

• Anatre, folaghe e svassi: uccelli adattati alla vita acquatica, si nutrono di piante, pesci e insetti.

• Gabbiani: uccelli marini con volo elegante e richiamo squillante.

• Aironi: uccelli acquatici di grandi dimensioni, specializzati nella caccia di pesci.

• Germani reali: anatre di medie dimensioni, con maschio vistosamente colorato.

• Sterne: uccelli marini con ali lunghe e adatte al volo rapido.

• Cormorani: uccelli capaci di immersioni sott'acqua per cacciare pesci.

L'oasi è inoltre habitat per anfibi, rettili, pesci e una varietà di insetti e mammiferi che contribuiscono alla ricchezza biologica del territorio. 

• Biacco: serpente non velenoso noto anche come "serpente di cervo", comune nelle aree boschive e umide.

• Biscia dal collare: serpente non velenoso, caratterizzato da un collare giallo o bianco intorno al collo, spesso avvistato lungo le rive dei corsi d'acqua.

• Ramarro: lucertola verde con due linee chiare lungo i fianchi, trovata in aree aperte e soleggiate come prati e bordi dei boschi.

• Salamandra pezzata: anfibio con una caratteristica livrea nera con macchie gialle, che preferisce gli ambienti umidi dei boschi e dei prati.

• Rane: anfibi dal corpo tozzo e zampe corte, spesso avvistati durante la stagione riproduttiva nelle pozze d'acqua della zona.

• Anguille: pesci dalla forma allungata, adattati alla vita in acqua dolce e marina.

• Pesci vari come carpe, tinche e lucci: diverse specie di pesci che abitano le acque della laguna.