A Vigilância Epidemiológica tem como missão proporcionar o conhecimento, a detecção ou prevenção de qualquer mudança nos fatores determinantes e condicionantes de saúde individual ou coletiva, com a finalidade de recomendar e adotar as medidas de prevenção e controle das doenças ou agravos (Lei 8080/90 Art.6º §2º).

Tem como propósito fornecer orientação técnica permanente para os responsáveis pela decisão e execução de ações de controle de doenças e agravos, através do acompanhamento do comportamento epidemiológico das doenças sob vigilância, podendo detectar epidemias e eventos de relevância epidemiológica, propiciar a adoção oportuna de medidas de controle, avaliar as medidas, programas, intervenções de prevenção, controle e erradicação.

O trabalho operacional do setor compreende um ciclo completo de funções específicas e intercomplementares que devem ser desenvolvidas de modo contínuo, permitindo conhecer, a cada momento, o comportamento epidemiológico do evento, doença ou agravo objeto das ações, para que as medidas de intervenção pertinentes possam ser desencadeadas com efetividade e oportunidade e compreende: