TBI Motaain dibangun sebagai fasilitas penunjang kegiatan transportasi dan logistik lintas batas negara yang berfungsi untuk mendukung kelancaran arus barang ekspor, impor, dan distribusi barang antarnegara. Keberadaan terminal ini merupakan bagian dari upaya pemerintah dalam meningkatkan konektivitas, memperlancar perdagangan internasional, serta mendorong pertumbuhan ekonomi di kawasan perbatasan.

Sebagai tempat pelayanan kendaraan angkutan barang, pengaturan lalu lintas kendaraan logistik, pemeriksaan administrasi dan kelengkapan kendaraan, serta pendataan pergerakan barang dan kendaraan yang melintasi perbatasan. Selain itu, terminal ini menjadi sarana koordinasi berbagai instansi terkait, seperti Bea dan Cukai, Karantina, Imigrasi, Kepolisian, dan instansi lainnya dalam rangka mendukung pelayanan terpadu di kawasan perbatasan

Sebagai simpul transportasi logistik nasional di wilayah perbatasan, TBI Motaain memiliki peran strategis dalam meningkatkan efisiensi distribusi barang, menjamin keselamatan dan keamanan angkutan barang, serta mendukung pengembangan kawasan perbatasan sebagai pusat pertumbuhan ekonomi baru. Melalui penyelenggaraan pelayanan yang profesional, akuntabel, dan berorientasi pada kepuasan pengguna jasa, TBI Motaain berkomitmen untuk mendukung terwujudnya sistem transportasi darat yang handal, terintegrasi, dan berkelanjutan sesuai dengan visi Kementerian Perhubungan dalam mewujudkan konektivitas nasional yang efektif dan efisien.