焼香太鼓は、巴太鼓と同型ながらやや大きく、金銀の装飾や菊紋を施した格式の高い太鼓です。明治三十年（1897）に極楽院より下賜されたと伝えられています。

かつては「焼香太鼓」という演目もあったといわれますが、現在は伝承されていません。主に発願念仏・結願念仏の際の「打ち出し」や「阿弥陀打ち」に用いられ、儀礼的な場面を象徴する楽器となっています。

六斎念仏では、二つの鉦を一人で擦る「二丁吊り」を用います。すべての演目で使用されます。二股のスリを用いて二つの鉦を同時に打ち、華やかな音色を響かせます。三つ耳の鉦で、囃子鉦よりもやや小ぶりです。

京都の芸能六斎が、各地の六斎念仏と異なる点の一つは「笛」を用いることです。笛の音が加わったのは、風流や色物など、本来の念仏とは異なる芸能的要素が取り入れられた結果と考えられています。

千本六斎の笛は六孔の囃子笛で、一般的な篠笛と比べると胴周りが大きく、芯の太い落ち着いた音色が特徴です。他会の笛も同寸法であることが知られており、共通のルーツを持つと考えられます。

大太鼓は、六斎念仏の中で最も低音を担う太鼓です。六斎念仏特有の持ち手が付けられており、演技と一体となって扱われます。比較的高い音域の楽器が多い中で、迫力ある低音を響かせる存在として、演出上の聴かせどころを担います。演目の節目で打つ「触れ太鼓」にも用いられるほか、四ツ太鼓、願人坊、そして獅子舞の「地廻り」などで演奏されます。