Bordadura blanca: simboliza la virginidad, pureza, inocencia y bondad. Expresa que el ambiente de Saquisilí es tal en su acepción y valor.
Cantón superior: el cielo rojo o guales simboliza el valor, ardimiento e intrepidez. Los volcanes púrpura significan la justicia, ingenio y grandeza.
Cantón central: el fondo verde simboliza la esperanza,
abundancia y libertad. El palacio en oro, simboliza la Casa o Palacio Municipal con su fe, riqueza y pureza. El maíz: es símbolo de riqueza y pureza en la agricultura y el Uso de Hilado simboliza a la riqueza ganadera, elementos necesarios e imprescindibles para la vida en general, ya que constituyen el elemento substancial para la vida del hombre humilde y del poderoso. El maíz viene siendo desde tiempos muy remotos pan y vino del hombre, holocausto que une al hombre y a la tierra. El río en plata, simboliza al río Pumacuchi, Acchi, Tilichi, Yanayacu y Yanahurco comprados a la Corona Española el año 1608 por el Cacique Saquisileño Don Sancho Hancho Pullipaxi en prorratec. El color plata significa e indica pureza, inocencia, bondad y virginidad.
Cantón inferior: el puente amarillo, significa el soporte cultural, físico intelectual del Cantón Saquisilí por su valor en asocio de la fe, riqueza, sinceridad y pureza. El vacío significa la libertad de acción en el suelo de Saquisilí, limitado siempre por los horizontes de la razón. Dé soporte, en cinta espiral laterales abierta en punta color amarillo está escrito la fecha de la Canonización soportando a la base la inscripción Ciudad de Saquisilí color tipo barra.