La cuenca alta del Otún corresponde a la zona de vida de bosque andino y bosque subandino, cuenta con 10 complejos los cuales se pueden abordar desde la perspectiva de microcuenca hidrográfica, estos 10 complejos se pueden relacionar con la distribución de veredas de la siguiente manera: el complejo de La Pastora pertenece a la vereda El Bosque, los complejos de El Ceilán, La Beira, El Amparo San Marcos, Los Génaros, Lisbrán y 4 de los humedales presentes en El Cedral pertenecen a la vereda El Cedral, sin embargo 2 humedales pertenecientes al complejo de El Cedral pertenecen a la vereda La Suiza, al igual que los complejos de Sierra Morena y el Santuario de Fauna y Flora Otún Quimbaya. Por otro lado, los complejos de La Florida y la Bananera corresponden a las veredas de La Florida y La Bananera, respectivamente.