(圖片來源:維基百科、農業知識入口網)
北京鴨
和褐色菜鴨的共同祖先是綠頭鴨,但北京鴨是肉鴨;褐色菜鴨是蛋鴨。
番鴨
又稱為疣鼻棲鴨,原產地是南美洲,也是薑母鴨的原料。
土番鴨
公黑色番鴨和母褐色番鴨人工輔助受精後形成二品種黑色土番鴨;公北京鴨和母白色菜鴨受精後形成母改鴨,在和公白色番鴨受精形成三品種白色土番鴨。
材料:
2X Powerpol MasterMix: 150μL
ddH2O 300μL
Duck DNA:
Pekin, Mule, Muscovy 5μL each 1.5 ml Eppendorf 2個
八連 PCR 管1個
引子:
5μL CHD primer (Forward)
5μL CHD primer (Reverse)
5μL CAUD006 primer (Forward)
5μL CAUD006 primer (Reverse)
步驟:
取 Eppendorf ,加入 52.5μL ddH2O 和 62.5μL MasterMix
加入2.5μL CHD primer (Forward)、2.5μL CHD primer (Reverse)
取2.之混合液24μL 分別加入其中四個PCR管
重複步驟1.
將4.的Eppendorf加入2.5μL CAUD006 primer (Forward)、2.5μL CAUD006 primer (Reverse)
取5.之混合液24μL 分別加入另外四個PCR管
在PCR管中依照順序加入對應的DNA (NC為加入ddH2O的對照組)
進行PCR,循環如右圖所示
進行電泳分析
材料:
2X Powerpol MasterMix : 80 μl
ddH2O : 300 μl
rCutSmart buffer 20μl
Sma1 酵素: 請助教幫忙加入
八連 PCR 管 1 個
引子:
5μl Sma1 primer (Forward)
5μl Sma1 primer (Reverse)
步驟:
取 Eppendorf ,加入 52.5μL ddH2O 和 52.5μL MasterMix
加入2.5μL Sma1 primer (Forward)、2.5μL Sma1 primer (Reverse)
取2.之混合液24μL 分別加入其中四個PCR管
在PCR管中依照順序加入對應的DNA (NC為加入ddH2O的對照組)
進行PCR,循環同前一實驗所示
取PCR產物各20μL,分別加入另外4個PCR管
分別加入5μL rCutSmart buffer、24μL ddH2O
助教協助分別加入1μL Sma1 enzyme
再次進行PCR,溫度時常如右下圖所示
進行電泳分析
圖片由左至右分別為:pekin uncut、mule uncut、musc uncut、negative contorl uncut、marker、pekin cut 、mule cut 、musc cut 、negative contorl cut。從圖中可以看出,除了marker其他well都沒有肉眼可可見的條帶,與negative contorl 相同。可以推論,PCR應該有出問題,造成DNA片段無法擴增。推論其原因可能為primer出問題或PCR 機器有狀況。
在課程中,我們學習PCR的操作,包含加入DNA、buffer、primer......,再加上精準醫學與生醫檢測中我們學到如何抽取DNA。我們在營隊中最後學到了從抽DNA到PCR的全過程,這是相當不簡單的。雖然我們最後的實驗失敗了,但應該不是我們操作上的失誤,而是其他原因。因為其他三組也沒有做出來。這讓我們思考失敗的原因,是primer設計有問題?PCR machine 壞掉?還是DNA樣品有問題?若時間充足,我們應該再做幾次實驗,依次排除問題,找出失敗的原因,否則下次再做相同的實驗依舊會失敗。