もじゃる丸の研究室
業績等
原著論文
2018
1. Masatomo Takahashi, Yoshihiro Izumi, Fukumatsu Iwahashi, Yasumune Nakayama, Mitsuhiko Iwakoshi, Motonao Nakao, Seiji Yamato, Eiichiro Fukusaki, and Takeshi Bamba, Highly Accurate Detection and Identification Methodology of Xenobiotic Metabolites Using Stable Isotope Labeling, Data Mining Techniques, and Time-Dependent Profiling Based on LC/HRMS/MS, Anal. Chem., 2018, 90 (15), pp 9068–9076, doi: 10.1021/acs.analchem.8b01388
2. Sastia Prama Putri, Yasumune Nakayama, Claire Shen, Shingo Noguchi, Katsuaki Nitta, Takeshi Bamba, Sammy Pontrelli, James Liao, Eiichiro Fukusaki, Identifying metabolic elements that contribute to productivity of 1-propanol bioproduction using metabolomic analysis, Metabolomics, 2018, 14: 96, doi: 10.1007/s11306-018-1386-0
3. Norihisa Haraguchi, Jun Kaseda, Yasumune Nakayama, Kazuhiro Nagahama, Takahira Ogawa, Masayoshi Matsuoka, Characterization of mutants expressing thermostable D1 and D2 polypeptides of photosystem II in the cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942, J. Biosci. Bioeng., 2018, in press, doi: 10.1016/j.jbiosc.2018.04.015
4. Miwa Ohnishi, Aya Anegawa, Yuko Sugiyama, Kazuo Harada, Akira Oikawa, Yasumune Nakayama, Fumio Matsuda, Yukiko Nakamura, Ryosuke Sasaki, Chizuko Shichijo, Patrick G Hatcher, Hidehiro Fukaki, Shigehiko Kanaya, Koh Aoki, Mami Yamazaki, Eiichiro Fukusaki, Kazuki Saito, Tetsuro Mimura, Molecular components of Arabidopsis intact vacuoles clarified with metabolomic and proteomic analyses. PCP, 2018, in press, doi:10.1093/pcp/pcy069（原著論文，査読あり）
5. Yukiko Takeuchi, Yasumune Nakayama, Eiichiro Fukusaki, Yasuhiro Irino, Glutamate production from ammonia via glutamate dehydrogenase 2 activity supports cancer cell proliferation under glutamine depletion. BBRC, 495, 2018 （原著論文，査読有り）
2017
6. Hirofumi Nagao, Hitoshi Nishizawa, Takeshi Bamba, Yasumune Nakayama, Noriyoshi Isozumi, Shushi Nagamori, Yoshikatsu Kanai, Yoshimitsu Tanaka, Shunbun Kita, Shiro Fukuda, Tohru Funahashi, Norikazu Maeda, Eiichiro Fukusaki, Iichiro Shimomura;, Increased Dynamics of Tricarboxylic Acid Cycle and Glutamate Synthesis in Obese Adipose Tissue: In vivo Metabolic Turnover Analysis. JBC, 292, 2017 （原著論文，査読有り）
2016
7. Moriyama, T.; Tanaka, S.; Nakayama, Y.; Fukumoto, M.; Tsujimura, K.; Yamada, K.; Bamba, T.; Yoneda, Y.; Fukusaki, E.; Oka, M.; Two isoforms of TALDO1 generated by alternative translational initiation show differential nucleocytoplasmic distribution to regulate the global metabolic network. Scientific reports, In Press, 2016 （原著論文，査読有り）
8. Teoh, S.T.; Kitamura, M.; Nakayama, Y.; Sastia P.P.; Mukai, Y.; Fukusaki, E., Random Sample Consensus combined with Partial Least Squares regression (RANSAC-PLS) for microbial metabolomics data mining and phenotype improvement. J. Biosci. Bioeng. 122, 168-175, 2016（原著論文，査読あり）
2015
9. Ohta, E.; Nakayama, Y.; Mukai, Y.; Bamba, T.; Fukusaki, E., Metabolomic approach for improving ethanol stress tolerance in Saccharomyces cerevisiae. J. Biosci. Bioeng. 121, 399-405, 2015（原著論文，査読あり）
10. Shimizu, R.; Dempo, Y.; Nakayama, Y.; Nakamura, S.; Bamba, T.; Fukusaki, E.; Fukui, T., New insight into the Role of the Calvin Cycle: Reutilization of CO2 Emitted through Sugar Degradation. Scientific reports, 5, 2015（原著論文，査読あり）
11. Huang, H.; Kawamata, T.; Horie, T.; Tsugawa, H.; Nakayama, Y.; Ohsumi, Y.; Fukusaki, E., Bulk RNA degradation by nitrogen starvation-induced autophagy in yeast. EMBO J., 34, 154-168, 2015（原著論文，査読あり）
2014
12. Gheni, G.; Ogura, M.; Iwasaki, M.; Yokoi, N.; Minami, K.; Nakayama, Y.; Harada, K.; Hastoy, B.; Wu, X.; Takahashi, H.; Kimura, K.; Matsubara, T.; Hoshikawa, R.; Hatano, N.; Sugawara, K.; Shibasaki, T.; Inagaki, N.; Bamba, T.; Mizoguchi, A.; Fukusaki, E.; Rorsman, P.; Seino, S., Glutamate acts as a key signal linking glucose metabolism to incretin/cAMP action to amplify insulin secretion. Cell Rep., 9, 661–73. 2014（原著論文，査読あり）
13. Kamei, Y.; Tamada, Y.; Nakayama, Y.; Fukusaki, E.; Mukai, Y., Changes in transcription and metabolism during the early stage of replicative cellular senescence in budding yeast. J. Biol. Chem., 289, 32081–93. 2014（原著論文，査読あり）
14. Nakayama, Y.; Tamada, Y.; Tsugawa, H.; Bamba, T.; Fukusaki, E., Novel strategy for non-targeted isotope-assisted metabolomics by means of metabolic turnover and multivariate analysis. Metabolites, 4, 722–739. 2014（原著論文，査読あり）
15. Dempo, Y.; Ohta, E.; Nakayama, Y.; Bamba, T.; Fukusaki, E., Molar-based targeted metabolic profiling of cyanobacterial strains with potential for biological production. Metabolites, 4, 499–516. 2014（原著論文，査読あり）
16. Nakayama, Y.; Putri, S. P.; Bamba, T.; Fukusaki, E., Metabolic distance estimation based on principle component analysis of metabolic turnover. J. Biosci. Bioeng., 118, 350–355. 2014（原著論文，査読あり）
17. Fukui, T.; Chou, K.; Harada, K.; Orita, I.; Nakayama, Y.; Bamba, T.; Nakamura, S.; Fukusaki, E., Metabolite profiles of polyhydroxyalkanoate-producing Ralstonia eutropha H16. Metabolomics, 10, 190–202. 2014（原著論文，査読あり）
2009
Ishikawa, K.; Ogawa, T.; Hirosue, E.; Nakayama, Y.; Harada, K.; Fukusaki, E.; Yoshimura, K.; Shigeoka, S., Modulation of the poly (ADP-ribosyl) ation reaction via the Arabidopsis ADP-ribose/NADH pyrophosphohydrolase, AtNUDX7, is involved in the response to oxidative stress. Plant physiol., 151, 741-754. 2009（原著論文，査読あり）
総説、解説
2017
1. 中山泰宗，松田史生，メタボロミクスにおける動態解析―質量分析と同位体標識を用いて代謝の流れを測定する―，日本質量分析学会，65，210-214，2017
2013
2. Sastia, P.P.; Nakayama, Y.; Matsuda, F.; Uchikata, T.; Kobayashi, S.; Matsubara, A.; Fukusaki, E., Current metabolomics: Practical applications. J. Biosci. Bioeng., 115, 579-589. 2013（総説，査読あり）
書籍
2013
1. 山本慎也, 中山泰宗, 福崎英一郎. 1.12.質量分析データの正しい見方. 生物工学よもやま話. 生物工学会 編. 学進出版: 神奈川. 日本. 70-74，2013
2012
2. 山本慎也, 津川裕司, 中山泰宗, 福崎英一郎. 2012. 第2章 新規探索・機能解析・改変技術 4)メタボロミクス. 極限環境生物の産業展開. 今中忠行 監. CMC出版: 東京, 日本. 59-64
学会発表
2017
1. 竹内由紀子，中山泰宗，福崎英一郎，入野康宏，アンモニアを利用するがん細胞は栄養飢餓状態でも生存できる，2017年度生命科学系学会合同年次大会（神戸），12月
2. 中山泰宗，和泉自泰，長濱一弘，松岡正佳，馬場健史，質量分析のダイナミックレンジ拡張技術の開発とメタボロミクスへの応用，第11回メタボロームシンポジウム（大阪），2017年，11月
3. 高橋政友，和泉自泰，岩橋福松，中山泰宗，岩越光彦，中尾素直，大和誠司，福崎英一郎，馬場健史，LC/HRMS/MSを基盤とした外因性化学物質の代謝物探索法の開発，第11回メタボロームシンポジウム（大阪），2017年，11月
4. 中山泰宗，恐怖の誤同定，JASIS 2017, 2017年，9月
5. 竹内由紀子，中山泰宗，福崎英一郎，入野康宏，アンモニアを利用するがん細胞は栄養飢餓状態でも生存できる，第42回日本医用マススペクトル学会年会（東京），2017年，9月
6. 塩屋健一，鶴田開生，原口典久，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，光化学系Ⅱ反応中心に耐熱性D1/D2タンパク質を組み込んだシアノバクテリア変異株の作成とD1タンパク質C末端配列の最適化，第69回日本生物工学会大会（東京），2017年，9月
7. 魚住昇平，石原杏里，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，エチレン生成酵素遺伝子を組み込んだCorynebacterium glutamicumによるエチレン生産，第69回日本生物工学会大会（東京），2017年9月
8. Yasumune Nakayama, Takeshi Bamba, Eiichiro Fukusaki, Black List of Metabolomics by In-source Decay, metabolomics 2017, June, 2017年，6月
9. 塩屋健一，鶴田開生，原口典久，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，光化学系ⅡD1タンパク質のC末端アミノ酸配列の相違が異種D1タンパク質のC末端プロセシングに影響を与える，日本光合成学会2017年会（大津），2017年，5月
10. 鶴田開生，田中誠，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，光化学系ⅡD1タンパク質C末端プロセシングの最適化による耐熱性D1/D2ヘテロダイマーの中温性シアノバクテリアでの発現，日本植物生理学会2017年会（鹿児島），2017年，3月
2016
11. 鶴田開生，田中誠，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，シアノバクテリア光化学系ⅡのD1タンパク質C末端プロセシング最適化による耐熱性D1/D2ヘテロダイマーの発現，第23回日本生物工学会九州支部大会（飯塚），2016年，12月
12. 池田萌子，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，glnB遺伝子変異シアノバクテリアを宿主としたエチレン生産，第23回日本生物工学会九州支部大会（飯塚），2016年，12月
13. 西崎絵理，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，シアノバクテリア染色体コピー数調節機構の解析，第23回日本生物工学会九州支部大会（飯塚），2016年，12月
14. 北村将大，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，酵母YCp型プラスミドの安定性に及ぼす音響処理の効果，第23回日本生物工学会九州支部大会（飯塚），2016年，12月
15. 冨永祥子，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，光合成細菌と窒素固定細菌の共培養，第23回日本生物工学会九州支部大会（飯塚），2016年，12月
16. 松原匡兵，木場沙耶，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，多機能乳酸菌のスクリーニング，第23回日本生物工学会九州支部大会（飯塚），2016年，12月
17. 小西絵莉奈，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，イグサJuncus effususの有効利用に関する研究，第23回日本生物工学会九州支部大会（飯塚），2016年，12月
18. 伊藤圭司，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，Ewingella sp. KTHG3株のフェノール酸脱炭酸能，第23回日本生物工学会九州支部大会（飯塚），2016年，12月
19. 中山泰宗，” LC/MS のインソースフラグメントによる化合物誤同定とその回避策“（招待講演），第10回メタボロームシンポジウム，2016年10月
20. 長尾博文、西澤、馬場健史，中山泰宗、永森收志、金井好克、喜多俊文、田中紀實、福田士郎、前田法、船橋徹、福崎英一郎、下村伊一郎，“P-094 肥満脂肪組織におけるグルタミン酸上昇とその病態学的意義～in vivo代謝動態解析を用いて～”，第37回日本肥満学会，2016，10月
21. 鶴田開生, 田中誠, 原口典久, 中山泰宗, 長濱一弘, 松岡正佳，“光化学系II耐熱性D1/D2タンパク質とD1プロセシングプロテアーゼの中温性シアノバクテリアでの発現”，第68回日本生物工学会大会，2016，9月
22. Nakayama, Yasumune;, “Development of Dynamic Profiling of Metabolomics”, The 6th SOJO-UTP Joint Seminar on Nano and Bio Research, 2016，8月
23. Nakayama, Yasumune; Bamba, Takeshi, Fukusaki, Eiichiro;, “Avoiding compound miss-annotation caused by MS in-source decay using data-independent acquisition” , 12th International Conference of the Metabolomics Society（Metabolomics 2016）, 2016，6月
24. 松田史生，中山泰宗，馬場健史，“メタボロミクス研究におけるマトリックス効果とその対応”，第8回LCMSワークショップ，2016，10月
25. 盛山哲嗣，田中秀，福本昌宏，辻村賢二，山田幸司，中山泰宗，馬場健史，福崎英一郎，米田悦啓，岡正啓，“1,4異なる核―細胞質間分布を示す 2 つの Transaldolase 1 アイソフォームによる代謝ネットワークの制御”，第68回 日本細胞生物学会大会，2016，6月
26. 盛山哲嗣, 田中秀, 中山泰宗, 福本昌宏, 辻村賢二, 山田幸司, 馬場健史, 米田悦啓, 福崎英一郎, 岡正啓，”B13 異なる細胞内局在を示す２つのトランスアルドラーゼが糖代謝全体に影響を及ぼす”，第63回 日本生化学会，近畿支部例会，2016，5月
27. 長尾博文, 西澤均, 馬場健史, 中山泰宗, 永森收志, 金井好克, 喜多俊文, 田中紀實, 前田法一, 船橋徹, 福崎英一郎, 下村伊一郎，“肥満脂肪組織におけるin vivo代謝動態解析：グルタミン酸上昇とその病態学的意義”，第89回日本内分泌学会学術総会，2016年4月
28. 西村隆秀、高木祐子、中山泰宗、傳寶雄大、福崎英一郎、蘆田弘樹、陀安一郎、秋田求、泉井桂，“C4光合成の炭酸固定酵素と脱炭酸酵素のC3植物への導入による代謝系の改変：水ストレス耐性の向上とその基盤のメタボローム解析”，日本農芸化学会2016年度大会，2016年3月
2015
29. 住吉光樹，川添優，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，“シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942の光化学系Ⅱ複合体の酸素発生に及ぼすベタインの安定化効果”，第22回日本生物工学会九州支部大会，2015年12月
30. 川添優，住吉光樹，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，“耐熱性D1/D2ヘテロダイマーを組込んだシアノバクテリア光化学系Ⅱ複合体の精製とその特性”，第22回日本生物工学会九州支部大会，2015年12月
31. 田中美和，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，“キクイムシ腸内細菌Ewingella sp.の窒素固定系の解析”，第22回日本生物工学会九州支部大会，2015年12月
32. 下藤佑香，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，“Thermus thermophilusのコハク酸要求性変異株の解析”，第22回日本生物工学会九州支部大会，2015年12月
33. 赤池利仁，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，“低温発現系によるエチレン生成酵素の精製”，第22回日本生物工学会九州支部大会，2015年12月
34. 長尾博文、西澤均、馬場健史、中山泰宗、永森收志、金井好克、喜多俊文、田中紀實、福田士郎、前田法一、船橋徹、福崎英一郎、下村伊一郎，“肥満脂肪組織におけるグルタミン酸上昇とその病態学的意義 ～メタボロミクス解析より～”，第36回日本肥満学会，2015年10月
35. 住吉光樹，川添優，地原稔貴，原口典久，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，“耐熱性D1/D2ヘテロダイマーを組み込んだシアノバクテリア光化学系II複合体の特性”，第67回日本生物工学会大会，2015年10月
36. 傳寳雄大, 中山泰宗, 福﨑英一郎，“藍藻におけるTCA サイクルの動態代謝プロファイリング技術の開発”，第67回日本生物工学会大会，2015年10月
37. 松永光平, 傳寳雄大, 中山泰宗, 向由起夫, 福﨑英一郎，“遺伝子機能推定における代謝ターンオーバー解析の性能評価” ，第67回 生物工学会大会，2015年10月
38. 深水大樹, 傳寳雄大, 中山泰宗, 石川森夫, 貝沼（岡本）章子, 福﨑英一郎，“メタボロミクスに基づく酢酸菌Acetobacter pasteurianus のグルコース代謝の解明”，第67回 生物工学会大会，2015年10月
39. 中山泰宗，“ノンターゲットメタボロミクスにおけるピットフォールと回避策－エレクトロスプレーイオン化法による代謝物のインソース分解と誤同定－”，第67回 日本生物工学会大会（ランチョンセミナー），2015年10月
40. Yudai Dempo, Yasumume Nakayama, Eiichiro Fukusaki, “Stable Isotope-Assisted Analysis for Cyanobacterial TCA Cycle by Integrating Multiple Analytical Systems”, Aachen-Osaka Joint Symposium Biological and Chemical Methods for Selective Catalysis, 2015年9月
41. Yudai Dempo, Yasumune Nakayama, Takeshi Bamba, Eiichiro Fukusaki, “Stable isotope-assisted analysis for cyanobacterial TCA cycle by integrating multiple analytical systems”, 11th International Conference of the Metabolomics Society（Metabolomics2015）, 2015年6月
42. 西村隆秀，中山泰宗，傳寳雄大，福崎英一郎，西村秀希，且原真木，秋田求，泉井桂，“C4光合成のCO2代謝酵素の導入によるC3植物の機能向上：メタボロームおよびトランスクリプトーム解析による性格付け”，第6回日本光合成学会年次大会，2015年5月
43. 住吉光樹，川添優，地原稔貴，原口典久，中山泰宗，長濱一弘，松岡正佳，“耐熱性D1/D2ヘテロダイマーを発現するシアノバクテリアSynechococcus elongatus組み換え体の特性”，第6回日本光合成学会年次大会，2015年5月
44. Putri, Sastia Prama; Nakayama, Yasumune; Shen, Claire; Liao, James C; Bamba, Takeshi and Fukusaki, Eiichiro:, “P110; Metabolic profiling and turnover analysis reveal the importance of synergy between two pathways for 1-propanol production in Escherichia coli.”, Metabolomics 2014，山形，2014年6月23日～26日
45. Dempo, Yudai; Ohta, Erika; Nakayama, Yasumune; Bamba, Takeshi Fukusaki, Eiichiro:, “P76 Metabolic characterization of three cyanobacterial strains by molar-based metabolic profiling.”, Metabolomics 2014，山形，2014年6月23日～26日
46. Huang, Hanghang; Kawamata, Tomoko; Tsugawa, Hiroshi; Nakayama, Yasumune; Bamba, Takeshi; Ohsumi, Yoshinori and Fukusaki, Eiichiro:, “P74 Metabolic and molecular dissection of bulk RNA degradation via autophagy in yeast”, Metabolomics 2014，山形，2014年6月23日～26日
47. 喜多村美紀，中山泰宗，Teoh Shao Thing，向由起夫，馬場健史，福崎英一郎, “メタボローム情報による回帰モデル構築のためのサンプル選択アルゴリズムの開発”, 第65回 日本生物工学会大会，広島，2013年9月18日～20日
48. 傳寳雄大，中山泰宗，馬場健史，福崎英一郎, “安定同位体標識による藍藻の動的代謝プロファイリング”, 第8回 メタボロームシンポジウム，2013年10月3日～4日
49. 中山泰宗，津川裕司，玉田佳大原田和生，馬場健史，福崎英一郎, “ノンターゲットアプローチによるGC/MS 代謝ターンオーバー解析”, 日本農芸化学会2013年大会，山形，2013年3月27日
50. 傳寳雄大，中山泰宗，原田和生，馬場健史，福崎英一郎, “13C安定同位体希釈に基づく新規代謝ターンオーバー解析システムの提案”, 日本農芸化学会2013年大会，山形，2013年3月27日
51. Dempo, Yudai; Nakayama, Yasumune; Harada, Kazuo; Bamba, Takeshi and Fukusaki, Eiichiro:, “SUGGESTION OF A NOVEL METABOLIC TURNOVER ANALYSIS SYSTEM BASED ON 13C STABLE ISOTOPE DILUTION”, International Joint Symposium on Single-Cell Analysis，京都，2012年11月27日
52. Nakayama, Yasumune; Bamba, Takeshi and Fukusaki, Eiichiro:, “METABOLIC TURNOVER ANALYSIS BY MEANS OF STABLE ISOTOPE DILUTION BASED TIME COURSE OBSERVATION OF METABOLITE ISOTOPOMER RATIO CHANGE”, International Joint Symposium on Single-Cell Analysis，京都，2012年11月27日
53. 中山泰宗, 玉田佳大, 津川裕司, 馬場健史, 福崎英一郎, “P-37 GC/MSターンオーバー解析による出芽酵母の代謝動態解析”, 第7回 メタボロームシンポジウム，山形，2012年10月10日～12日
54. Nakayama, Yasumune; Bamba, Takeshi and Fukusaki, Eiichiro:, “Dynamic analysis of central metabolic pathway using time course of isotopomer ration change”, Osaka Aachen Mini symposium，大阪，2012年3月12日
55. Nakayama, Yasumune; Bamba, Takeshi and Fukusaki, Eiichiro:, “Dynamic analysis of central metabolic pathway using time course of isotopomer ration change”, Osaka Aachen Mini symposium，ドイツ，2011年12月13日
56. 玉田佳大，中山泰宗，津川裕司，堤浩子，馬場健史，福崎英一郎, “GC/MSによる清酒酵母の代謝ターンオーバー解析”, 第6回 メタボロームシンポジウム，大阪，2011年10月13日～14日
57. 玉田佳大，中山泰宗，津川裕司，堤浩子，馬場健史，福崎英一郎, “GC/MSによる清酒酵母の代謝ターンオーバー解析”, 第63回 生物工学会大会，東京，2011年9月26日
58. 福居俊昭，長健太，原田和生，中山泰宗，折田和泉，馬場健史，中村聡，福崎英一郎，“ポリエステル生産菌Ralstonia eutrophaのメタボローム解析”, 日本農芸化学会2011年大会，京都，2011年3月26日（東北地方太平洋沖地震のため中止．しかしながら，発表は成立したとの学会の解釈）
59. 中山泰宗，馬場健史，福崎英一郎, “安定同位体希釈率の経時変化情報による中央代謝ターンオーバー解析”, 第62回 日本生物工学会大会，宮崎，2010年10月28日
60. 中山泰宗，馬場健史，福崎英一郎, “安定同位体希釈率の経時変化情報による中央代謝ターンオーバー解析”, 第5回 メタボロームシンポジウム，鶴岡，2010年9月10日
61. Nakayama, Yasumune; Bamba, Takeshi and Fukusaki, Eiichiro:, “Turnover analysis of Central metabolism by time course of stable isotope dilution rate”, KAIST－阪大学生シンポジウム，兵庫，2010年7月22日～24日