Il complesso del Museo del Mare si trova nel Castello-Fortezza di Santa Pola. Ha tre sezioni diverse:1. Storia e archeologia (accesso all'ala sud);Si presenta come una mostra monografica, incentrata sulla Storia di Santa Pola, con tre temi principali: la Preistoria, gli Iberici, il Porto Romano e la storia del Castello-fortezza.2. Etnografia del mare e della pesca (accesso all'ala nord)La pesca è sempre stata un'importante fonte di ricchezza in sé, ma raggiunge dimensioni industriali quando l'uomo ha una maggiore conoscenza del mare e sa valorizzarne le risorse e sfruttarle. Il mare come scenario, il marittimo come protagonista e la barca come strumento, sono i tre elementi sostanziali che compongono la Storia Marittima e ne fanno una parte fondamentale della Storia dell'Umanità. Tutto questo si riflette nel Museo del Mare, facendo entrare i materiali esposti in un rapporto dialettico con l'ambiente circostante.3. Etnografia della musica e del mare (accesso all'ala nord)Questa sezione è composta da cinque sale dedicate alla musica a Santa Pola e ai resti archeologici della Torre di Cap de l'Aljub, il predecessore dell'attuale Castello-fortezza.La Torre del Cap de l'Aljub, costruita nel XIV secolo, ha generato intorno ad essa una casa colonica con una chiesa, un forno per il pane e alcuni negozi per rifornire soldati e marinai, oltre che per conservare e proteggere le merci dai furti e dalle intemperie.La sezione Musica è composta da tre sale, due dedicate ai maestri Quislant e Alfosea e una alle Bande Musicali come Unió Musical, Mare de Deu de Loreto, La Colla el Freu, Coral Levantina e Coral Villa de Santa Pola, per il loro contributo alla cultura e alle tradizioni di Santa Pola.