Перші згадки про магічні квадрати були у давніх китайців. Згідно з легендою, за часів правління імператора Ю (бл. 2200 до н.е.) з вод Хуанхе (Жовтої ріки) спливла священна черепаха, на панцирі якої були написані таємничі ієрогліфи і ці знаки відомі під назвою ло-шу і рівносильні магічному квадрату.
Встановити точну дату, коли людству прийшла ідея складання магічного квадрату, майже неможливо, але вже за часів античності нам відомо прообраз цієї гри, так званий магічний квадрат із слів.
Зміст цієї гри був в тому, щоб при розташуванні букв по горизонталі і вертикалі, отриманні одне й те саме значення.
Вважалося, що такого роду «Магічний квадрат» мають властивість приносити удачу, факт, тому часто зображали їх на стінах власних домівках.
Тому сучасні кросворди є нащадками «магічних квадратів».
Але в першу чергу цифрові «магічні квадрати» вважалися з давніх давен справді магічним амулетом в житті людини.
На протязі віків «магічний квадрат» застосовували як магічний засіб проти хвороб і життєвих негараздів (найбільше їх застосував лікар Парацельс).
Перший магічний квадрат з трьома клітинами в основі був описаний в арабському манускрипті кінця восьмого століття, де згадувався його автор - грецький філософ-неопіфагорієць Аполлоній Тіанський.
А перший твір про магічні квадрати було написано візантійським граматистом і лексикографом Мануелем Мосхопулосом (XIII-XIV ст.). У трактаті "Повчання по знаходженню числових квадратів" (приблизно 1300 р.).