Відділ почав працювати з дня відкриття музичної школи. Як навчально-виховний підрозділ відділ має свою основну мету: залучити учнів до світу музики, до його художніх цінностей, націлити їх на реалізацію своїх здібностей, творчості через виконання на духових і ударних інструментах. Духовий відділ самий більший за чисельністю музичних інструментів. Це дерев’янi духові інструменти (флейта, блок-флейта, пан-флейта, кларнет, саксофон, гобой) та мідні духові інструменти (тромбон, труба, туба, валторна). Першими викладачами були відомі музиканти – Федоренко I.Я., Шеремет I.В., Коган А.С.
Юлія Ляліна з учнями
Павло Гуєцький з учнями
Понад десятиріччя відділ очолював Дульдiєр Вiктор Афанасійович – старший викладач по класу кларнета та керівник оркестру духових та ударних інструментів. Сьогодні його справу продовжують завідувачка відділом Юлія Ляліна та керівник оркестру та викладач кларнету Генадій Ковтун. Вперше у Києві у 2003 році був відкритий клас пан-флейти. Сьогодні в школі працюють викладачі по класу флейти Ляліна Ю.Ю. та Лютенко Т.І., по класу пан-флейти викладач-методист Візнюк В. В., по класу труби викладач Гуєцький П. В., по класу ударних інструментів викладач Панченко Є. В. та Корнута В.І., саксофон викладає Котова-Іценко Т.О., концертмейстери: Гурова Х.В., Рубець І.А., Єлісєєва С.С., Великанич С.Р, Гуєцька С.Г.
Учні відділу є активними учасникам концертів школи та міста, лауреатами міських, Всеукраїнських та Міжнародних конкурсів.
За всі роки роботи викладачі відділу духових та ударних інструментів виховали плеяду прекрасних виконавців, що поповнили провідні оркестри і навчальні заклади країни.